In-silico Analyse ligandspezifischer Rezeptorkonformationen sowie durch Ligandbindungsprozesse induzierte Aktivierungsmechanismen G-Protein-gekoppelter Rezeptoren auf molekularer Ebene am Beispiel des Histamin H1-Rezeptors und Histamin H4-Rezeptors

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In diesem Projekt sollen der Histamin H1- und H4-Rezeptor auf molekularer Ebene mit etablierten und von mir und Dr. H.-J. Wittmann neu entwickelten Modelling-Techniken charakterisiert werden, insbesondere im Hinblick auf die Vorhersage einer agonistischen bzw. antagonistischen Wirkung eines Liganden. Das Forschungsvorhaben wird dabei in zwei Schwerpunkte unterteilt: Im ersten Teilprojekt sollen H1-Antagonisten und H1-Agonisten, die von uns pharmakologisch am H1- und H4-Rezeptor charakterisiert wurden, in die Bindetasche inaktiver und aktiver Rezeptormodelle gedockt und mittels MD-Simulation stabile Ligand-Rezeptor-Konformationen berechnet werden. Im zweiten Teilprojekt soll der von mir und Dr. H.-J. Wittmann entwickelte Algorithmus LigPath verwendet werden, um mögliche Bindungspfade von Liganden in die Bindetasche der H1- und H4-Rezeptoren und die gegebenenfalls stattfindende Rezeptoraktivierung zu berechnen. Sämtliche Resultate sollen auf Ligand- und Rezeptor-abhängige Gemeinsamkeiten und Unterschiede hin untersucht werden.