Structure function relationships in the archaeal transcription machinery (A03)

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Das vollständig rekombinante Transkriptionssystem des Archaeons Pyrococcus furiosus wird als Modell zur Analyse von Struktur-Funktionsbeziehungen in der RNA Polymerase herangezogen. Im Einzelnen werden folgende Fragestellungen bearbeitet: Die Rolle der trigger-loop der RNA Polymerase beim Einbau von Nukleotiden im aktiven Zentrum des Enzyms; die Rolle und Lokalisation von TFE im Initiations- und Elongationskomplex, sowie die Interaktion von TFE mit dem E´-F –Subkomplex der RNA Polymerase. Die Funktion von TFB, insbesondere beim Übergang, Initiation zur Elongation. Außerdem wird die Interaktion von wildtypischen und mutierten archaeellen RNAP –Untereinheiten mit eukaryotischen RNA Polymerasen analysiert.