Quantification of microbial cells and extracellular DNA abundance in South Pacific Gyre sediments (IODP Exp 329). Evaluation of extracellular DNA as a nutrient source

南太平洋环流沉积物中微生物细胞和细胞外 DNA 丰度的定量 (IODP Exp 329)。

• 批准号: 202964661
• 负责人: Dr. Jens Kallmeyer
• 金额: --
• 依托单位: Sektion 3.7: Geomikrobiologie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Infrastructure Priority Programmes
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2010-12-31 至 2013-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/202964661?language=en
• 关键词: Quantification; microbial; cells; extracellular; DNA

IODP Expedition 329 erbohrte Sedimente aus dem südpazifischen Wirbel, dem oligotrophsten Gebiet der Ozeane. Diese Sedimente sind der nährstoffärmste Lebensraum und es ist nicht bekannt, wie die dort lebende mikrobielle Population unter solch extremer Nährstoffarmut überleben kann. Für oberflächennahe marine Sedimente wurde nachgewiesen, dass extrazelluläre DNA eine wichtige Funktion als Nahrungsquelle hat, insbesondere für Stickstoff und Phosphor. Bis jetzt gibt es noch keinerlei Informationen über die Rolle von extrazellulärer DNA in der tiefen Biosphäre. Das beantragte Projekt beabsichtigt, nicht nur die Sedimente aus dem südpazifischen Wirbel, sondern auch von anderen Standorten mit höheren Nährstoffkonzentrationen zu untersuchen um die Prozesse, welche die Erhaltung und den Abbau von extrazellulärer DNA in tiefen marinen Sedimenten kontrollieren. Darüber hinaus sollen die mikrobiellen Zellen in den Proben von Exp. 329 quantifiziert werden. In Kooperation mit Partnern, welche Viren und Endosporen quantifizieren, wird ein einmalig umfassender Datensatz über die Abundanz und Verteilung der lebenden Biomasse in der tiefen marinen Biosphäre erstellt werden.

IODP第329次考察从南极洲Wirbel，即Ozeane的寡营养Gebiet沉积物。这种沉积物是最小的生存空间，它并不意味着，就像最小的生存人口在最小的生存空间里一样。对于海洋沉积物来说，额外的DNA具有非常重要的功能，它被认为是粘性物质和磷。但这并不意味着生物芯片中额外的DNA的作用。这一项目的成功，不仅仅是因为它是由南太平洋Wirbel的沉积物引起的，也是因为它是由一个有着良好的Nährstoffkonzentrationen的标准来进行的，它也是一个控制海洋沉积物中额外的DNA的结果和结果。在实验中，我们可以找到一个很好的解决办法。329定量韦尔登。在与合作伙伴的合作中，将对活体和内生孢子进行定量分析，以获得韦尔登中活生物量的丰度和丰度。

项目成果

High virus-to-cell ratios indicate ongoing production of viruses in deep subsurface sediments

• DOI: 10.1038/ismej.2013.245
• 发表时间: 2014-07-01
• 期刊: ISME JOURNAL
• 影响因子: 11
• 作者: Engelhardt, Tim;Kallmeyer, Jens;Engelen, Bert
• 通讯作者: Engelen, Bert