シロアリにおけるゲノム構造と化学受容体遺伝子族の進化
白蚁化学感受器基因家族的基因组结构和进化
基本信息
- 批准号:21J10398
- 负责人:
- 金额:$ 0.96万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-04-28 至 2023-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
All genomes have been sequenced and assembled for this project. The final dataset includes 48 genomes, 26 of which are scaffolded. These genomes have an average N50 of 43 Mb, BUSCO completeness scores of 99.4%, and QV scores of 45. Pipelines for genome evolution have been tested and suggest that genome architecture is relatively well conserved across termites. Most structural variants consist of copy number variants (insertions and deletions) and transposable elements. An alignment and new phylogenetic tree are being generated to map the variants. Variants will then be linked to different ecological traits.I presented the preliminary results at two international and two domestic conferences. Manuscripts are in preparation.
所有的基因组已经测序和组装为这个项目。最终的数据集包括48个基因组,其中26个是支架。这些基因组的平均N50为43 Mb, BUSCO完整性评分为99.4%,QV评分为45。基因组进化的管道已经被测试,并表明基因组结构在白蚁中相对保守。大多数结构变异由拷贝数变异(插入和删除)和转座元素组成。正在生成一个校准和新的系统发育树来映射这些变体。然后,变异将与不同的生态特征联系起来。我在两个国际和两个国内会议上介绍了初步结果。手稿正在准备中。
项目成果
期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Near chromosome-level assemblies reveal that genome structure is highly conserved in termites
近染色体水平的组装揭示了白蚁的基因组结构高度保守
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Ainash Garifullina;Amy Q. Shen;柴 亜東,周 燕ジ,多賀谷 基博;Audisio Tracy Lynn & Bourguignon Thomas
- 通讯作者:Audisio Tracy Lynn & Bourguignon Thomas
Genome evolution in termites
白蚁的基因组进化
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:森田敦也;中山瑞穂;大島浩子;大島正伸;Rachapun Rotrattanadumrong;Audisio Tracy Lynn & Bourguignon Thomas
- 通讯作者:Audisio Tracy Lynn & Bourguignon Thomas
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
Audisio Tracy Lynn其他文献
Audisio Tracy Lynn的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
相似国自然基金
基于数字艺术与文旅大数据的新质非遗设计研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
产教融合视域下高职教师数智素养评价模型构建
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
物联网技术在智能教室监测监控中的应用研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于网络药理学和分子对接的毛黄堇抗炎镇痛机制研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
构建“地面+地下+低空”三维交通体系的探究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
工业传送带智能检测可视化服务平台的设计研究与应用实践
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于强化学习与深度学习结合的分类算法动态优化研究与示范应用
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
工业机器人健康评估及预测性故障诊断方法研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于深度学习的凸轮轴裂纹检测方法研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
轻质预应力装配式楼板研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
相似海外基金
REU Site: Research Experiences for Undergraduates in Genomics and Neuroscience
REU 网站:基因组学和神经科学本科生的研究经验
- 批准号:
2349224 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Continuing Grant
REU Site: Summer Undergraduate Research in Genetics and Genomics (SURGe)
REU 网站:遗传学和基因组学暑期本科生研究 (SURGe)
- 批准号:
2349410 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Continuing Grant
Director of Functional Genomics Initiative
功能基因组学计划主任
- 批准号:
MR/Z000068/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Research Grant
Conference: Broadening Participation at the 21st International Symposium on Rice Functional Genomics (ISRFG)
会议:扩大第21届国际水稻功能基因组学研讨会(ISRFG)的参与范围
- 批准号:
2422920 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Standard Grant
Genomics of extinction and isolation on Australian island arks
澳大利亚方舟灭绝和隔离的基因组学
- 批准号:
DE240100573 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Discovery Early Career Researcher Award
EVOGOODGENES: Deciphering the genomics and evolution of honest sexual signals
EVOGOODGENES:破译诚实性信号的基因组学和进化
- 批准号:
EP/X041921/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Research Grant
BIORETS: Genetics, Genomics, and Biology Research Experiences for Teachers in the Sciences
BIORETS:科学教师的遗传学、基因组学和生物学研究经验
- 批准号:
2341385 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Standard Grant
Improving future treatment options for menopausal symptoms by using genomics to understand aetiology
通过使用基因组学了解病因来改善更年期症状的未来治疗选择
- 批准号:
MR/Y003780/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Research Grant
Integrating deep phenotyping and functional genomics to understand the mechanistic basis of primary lymphatic anomalies
整合深层表型分析和功能基因组学,了解原发性淋巴异常的机制基础
- 批准号:
MR/Y013786/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Research Grant
Functional Genomics of Human Brain Development Cluster
人脑发育集群的功能基因组学
- 批准号:
MR/Y031016/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Research Grant














{{item.name}}会员




