一つの遺伝子をもつ２種類のRNA集団が融合RNAへ進化するための環境条件の解明

2種類のRNA（Beta-RNA、NDK-RNA）の継代は、低い濃度を維持しないと行えないと考えられていたが、前年度、継代条件を工夫することによって、先行研究よりも高い濃度で、継代を行うことに成功した。そして、この長期継代サンプルを調べると、両者が融合したRNAが存在していることが分かり、配列解析の結果、融合RNAは、融合していないRNAとは、異なった変異が固定されていることが分かった。本年度は、長期継代で出現した融合RNAと、継代中に進化したBeta-RNAとNDK-RNAの性質を調べた。前年度に配列解析で調べたサンプル内には、多くのサンプルで見られる変異に加え、わずかにしか見られない変異も存在した。まずは、多くのサンプルで見られる（重要であると考えられる）変異がRNAの複製活性や翻訳活性にどのような影響を及ぼしているか調べるために、わずかにしか見られない変異の影響を取り除いたRNAの作成にとりかかった。作成後、それぞれのRNAの複製活性、翻訳活性などの特長を調べた。また、研究成果を論文化するため、Beta-RNA、NDK-RNA、融合したRNAのクローニングを進め、より多くの配列を調べたり、融合したRNAが長期継代のどのタイミングで出現したのかを調べるために、継代初期から後期にかけて、１～3ラウンドごとにサンプル中の融合したRNAの有無を調べたりした。さらに、Rep-RNA、NDK-RNAの長期継代を模擬したシミュレーションプログラムを作成し、融合したRNAが系を優占する条件を調べた。論文投稿後、要求された、いくつかのリバイス実験を行っている。現在も、リバイス中である。

2種類のRNA（Beta-RNA、NDK-RNA）の継代は、低い濃度を維持しないと行えないと考えられていたが、前年度、継代条件を工夫することによって、先行研究よりも高い濃度で、継代を行うことに成功した。そして、この長期継代サンプルを調べると、両者が融合したRNAが存在していることが分かり、配列解析の結果、融合RNAは、融合していないRNAとは、異なった変異が固定されていることが分かった。本年度は、長期継代で出現した融合RNAと、継代中に進化したBeta-RNAとNDK-RNAの性質を調べた。前年度に配列解析で調べたサンプル内には、多くのサンプルで見られる変異に加え、わずかにしか見られない変異も存在した。まずは、多くのサンプルで見られる（重要であると考えられる）変異がRNAの複製活性や翻訳活性にどのような影響を及ぼしているか調べるために、わずかにしか見られない変異の影響を取り除いたRNAの作成にとりかかった。作成後、それぞれのRNAの複製活性、翻訳活性などの特長を調べた。また、研究成果を論文化するため、Beta-RNA、NDK-RNA、融合したRNAのクローニングを進め、より多くの配列を調べたり、融合したRNAが長期継代のどのタイミングで出現したのかを調べるために、継代初期から後期にかけて、１～3ラウンドごとにサンプル中の融合したRNAの有無を調べたりした。さらに、Rep-RNA、NDK-RNAの長期継代を模擬したシミュレーションプログラムを作成し、融合したRNAが系を優占する条件を調べた。論文投稿後、要求された、いくつかのリバイス実験を行っている。現在も、リバイス中である。