Cocrystal screening with molecular informatics and machine learning
Cocrystal screening with molecular informatics and machine learning
批准号:
21J14560
负责人:
HAO YINGQUAN
金额:
$0.96万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-28 至 2023-03-31
中文摘要
今年度、申請者は前年の研究成果の論文化と補足実験に取り込んだ。本研究で提案した モデルは未学習のテスト化合物に対し,従来のモデルを上回る共結晶の形成予測精度を示した。さらに,モデルを使用して,難水溶性APIであるNorfloxacinに対して共結晶スクリーニングを行った結果,2種類の新しい共結晶を予測し,実験的にも確認された。この成果は国際誌に掲載した。更に、申請者は共結晶の形成予測モデルにとどまらず、共結晶の溶解性の予測を試みた。申請者は溶解過程の中に重要な性質の一つである溶解速度に着目した。しかしながら、文献の測定条件はバラバラで、同一条件で測定した共結晶の溶解性質のデータを文献から収集するのは極めて困難であった。そのため、申請者は大量に共結晶の溶解性質を半自動的に測定できる装置を設計開発した。その結果、一日中IN-LINEで三サンプルの固有溶解速度を測定できる半自動装置を作成した。更に、抗菌薬sulfamethazineを主成分とした共結晶を十種類作成し、同一条件で固有溶解速度を測定した。残念ながら、本プロジェクト終了時、収集したデータの量が機械学習モデルの開発に必要な量に満たせなかった。しかし、申請者は量子化学計算を利用し、共結晶内の物質の相互作用パラメータを計算し、固有溶解速度と相関し、相関係数0.5を達成した。この手法を利用することで、共結晶を実際作成する前に共結晶の溶解速度をある程度予測できると考える。更に、この研究で制作した装置を活用し、データを大量収集した後、高精度な予測モデルの構築も期待できる。この研究結果は国際誌に掲載する予定である。この一連の研究成果を利用し、共結晶の形成だけではなく、作成された共結晶の熱物性、溶解性質を予測できるモデルと半自動~自動測定解析装置を共結晶開発プロセスに導入することで、開発の加速化と効率化に貢献できる。
英文摘要
今年度、申請者は前年の研究成果の論文化と補足実験に取り込んだ。本研究で提案した モデルは未学習のテスト化合物に対し,従来のモデルを上回る共結晶の形成予測精度を示した。さらに,モデルを使用して,難水溶性APIであるNorfloxacinに対して共結晶スクリーニングを行った結果,2種類の新しい共結晶を予測し,実験的にも確認された。この成果は国際誌に掲載した。更に、申請者は共結晶の形成予測モデルにとどまらず、共結晶の溶解性の予測を試みた。申請者は溶解過程の中に重要な性質の一つである溶解速度に着目した。しかしながら、文献の測定条件はバラバラで、同一条件で測定した共結晶の溶解性質のデータを文献から収集するのは極めて困難であった。そのため、申請者は大量に共結晶の溶解性質を半自動的に測定できる装置を設計開発した。その結果、一日中IN-LINEで三サンプルの固有溶解速度を測定できる半自動装置を作成した。更に、抗菌薬sulfamethazineを主成分とした共結晶を十種類作成し、同一条件で固有溶解速度を測定した。残念ながら、本プロジェクト終了時、収集したデータの量が機械学習モデルの開発に必要な量に満たせなかった。しかし、申請者は量子化学計算を利用し、共結晶内の物質の相互作用パラメータを計算し、固有溶解速度と相関し、相関係数0.5を達成した。この手法を利用することで、共結晶を実際作成する前に共結晶の溶解速度をある程度予測できると考える。更に、この研究で制作した装置を活用し、データを大量収集した後、高精度な予測モデルの構築も期待できる。この研究結果は国際誌に掲載する予定である。この一連の研究成果を利用し、共結晶の形成だけではなく、作成された共結晶の熱物性、溶解性質を予測できるモデルと半自動~自動測定解析装置を共結晶開発プロセスに導入することで、開発の加速化と効率化に貢献できる。
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Prediction of Melting Point and Fusion Enthalpy of Cocrystal by Machine Learning combined with molecular informatics
机器学习结合分子信息学预测共晶熔点和熔化焓
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Weicheng Fang, Naoki Takahashi, Tsuyoshi Horikawa, Yoshitaka Ohiso, Ruihao Xue, Shunto Katsumi, Tomohiro Amemiya, and Nobuhiko Nishiyama, Yingquan Hao]
通讯作者:
Yingquan Hao
DOI:
10.1021/acs.cgd.2c00812
发表时间:
2022-10
期刊:
Crystal Growth & Design
影响因子:
--
作者:
[Yingquan Hao;Ying-Chieh Hung;Y. Shimoyama]
通讯作者:
Yingquan Hao;Ying-Chieh Hung;Y. Shimoyama
A comparative research between atomic-based and chemical calculation-based descriptor for cocrystal screening machine learning model
基于原子和化学计算的共晶筛选机器学习模型描述符的比较研究
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
Acta Crystallographica Section A FOUNDATIONS AND ADVANCES
影响因子:
--
作者:
[Yingquan Hao, Ying-Chieh Hung, Yusuke Shimoyama]
通讯作者:
Yusuke Shimoyama
Screening of pharmaceutical cocrystal formation with machine learning by molecular informatics
通过分子信息学的机器学习筛选药物共晶形成
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Massaroli Stefano, Poli Michael, Peluchetti Stefano, Park Jinkyoo, Yamashita Atsushi, Asama Hajime, Hao Yingquan]
通讯作者:
Hao Yingquan
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