RNA切断酵素MazFに着目した硝化微生物の低活性状態への理解

关注RNA切割酶MazF了解硝化微生物的低活性状态

• 批准号: 21J14691
• 负责人: 葵 理恵
• 金额: $ 0.96万
• 依托单位: Waseda University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-28 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21J14691/
• 关键词: 亜硝酸酸化細菌; Toxin-Antitoxin; RNA切断酵素; MazF

本研究では、これまで、Nitrospiraに保存される2種類のRNA切断酵素MazFについてその酵素学的性質を調査した。これらMazFはRNAに対する配列特異性や至適条件が大きく異なるにもかかわらず、いずれのMazFの認識配列もNitrospiraのエネルギー代謝関連遺伝子に有意に多く存在することから、本酵素がNitrospiraの低活性状態への移行に関与することが示唆された。当該年度では、Nitrospiraに保存されるMazFを網羅的に調査すべく、全ゲノムが公開されている主なNitrospiraの単離株および集積培養された種、計11種類についてゲノム解析を行なった。その結果、既に単離された株よりも未だ単離に完全に成功していない集積株の方がMazFの数が多く、本酵素がNitrospiraの単離の難易度に直接的または間接的に影響していることが示唆された。また、本研究の当初の目的である、Nitrospiraの低活性状態への移行の一連の分子メカニズムの解明を達成するため、RT-ddPCRを用いてMazFの発現量の定量実験について条件検討を行い、細胞の培養条件、mRNAの抽出条件、質量分析器の運転条件などを決定した。

The purpose of this study is to preserve the genomic RNA cleavage enzymes, MazF enzymes, enzymes and enzymes. "MazF" RNA "" to "condition", "Nitrospira", "MazF", "Nitrospira", "Nitrospira", "son", "intentionally", "Nitrospira", "low activity status", "transition" and "instigation". In that year's annual program, Nitrospira saved the customer license of the MazF network, and the general manager of the Nitrospira network. There are several kinds of models, such as the number of products, the number of products, and the level of analysis and analysis. The results showed that the number of MazF in the collection of successful isolates was high, and that the enzyme Nitrospira was isolated. The results showed that the number of isolates was high. In this study, the original purpose of this study, Nitrospira low activity status migration, molecular understanding, MazF quantitative analysis, cell culture condition, mRNA extraction condition, quantitative analysis, quantitative analysis.

项目成果

NitrospiraにおけるToxin-Antitoxin機構の生理学的意義の解明

阐明 Nitrospira 毒素-抗毒素机制的生理意义

• 发表时间: 2021
• 作者: 葵理恵;宮本龍樹;岡部拓真;横田亜紀子;大田悠里;藤谷拓嗣;常田聡;野田尚宏
• 通讯作者: 野田尚宏

亜硝酸酸化細菌Nitrospiraにおける2種類のMazEF機構の機能解析

亚硝酸盐氧化细菌 Nitrospira 中两种 MazEF 机制的功能分析

• 发表时间: 2021
• 作者: 葵理恵;宮本龍樹;岡部拓真;横田亜紀子;大田悠里;藤谷拓嗣;常田聡;野田尚宏
• 通讯作者: 野田尚宏