郷土愛を育む小・中学校の環境教育に利用可能な環境DNA検出技術の確立
郷土愛を育む小・中学校の環境教育に利用可能な環境DNA検出技術の確立
批准号:
21K02473
负责人:
石黒 直哉
金额:
$1.91万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
中文摘要
小・中学校の環境教育で利用可能な、環境DNA分析手法を用いた希少野生生物の簡便かつ迅速な検出技術の確立を目指している。これまでの連携研究実績や地元小・中学校の教員との繋がりを考え、福井県越前市を対象地域とした。本市に生息する絶滅危惧種であるナガレホトケドジョウ、トミヨ、アベサンショウウオを対象とし、環境DNAの迅速検出技術の確立を試みている。①昨年度作成したトミヨ属特異的プライマープローブセットによるトミヨの特異的増幅が確認された。②このプライマープローブセットと昨年度作成したアベサンショウウオ特異的プライマープローブセットをを用いて、環境水か両種両種の環境DNAの検出を試みた。簡易抽出キットと酵素は昨年度個体から抽出したDNAを用いて最適だと導き出した組み合わせで行った。その結果、簡易抽出では、モバイル型、ベンチトップ型のいずれの装置でも検出されず、高純度精製によるもののみ検出された。簡易抽出は阻害物質の影響で検出されなかった可能性があるため、阻害物質除去剤を使用したところ、モバイル型・ベンチトップ型いずれの装置でも検出されなかった。そこで、サンプルの希釈溶液によるqPCRを行ったところ、池のサンプルのみモバイル型・ベンチトップ型いずれの装置でも検出された。③産卵時期を迎えたアベサンショウウオの環境水を採水しフィルターろ過、現場ろ過した環境水サンプルをモバイル型・ベンチトップ型qPCRで環境DNA検出を行った結果、実験室でフィルターろ過したもののみで検出された。但し、簡易な検出手法の確立からは遠ざかってしまう結果なので、今後は更なる簡易抽出法を試してみる必要がある。
英文摘要
小・中学校の環境教育で利用可能な、環境DNA分析手法を用いた希少野生生物の簡便かつ迅速な検出技術の確立を目指している。これまでの連携研究実績や地元小・中学校の教員との繋がりを考え、福井県越前市を対象地域とした。本市に生息する絶滅危惧種であるナガレホトケドジョウ、トミヨ、アベサンショウウオを対象とし、環境DNAの迅速検出技術の確立を試みている。①昨年度作成したトミヨ属特異的プライマープローブセットによるトミヨの特異的増幅が確認された。②このプライマープローブセットと昨年度作成したアベサンショウウオ特異的プライマープローブセットをを用いて、環境水か両種両種の環境DNAの検出を試みた。簡易抽出キットと酵素は昨年度個体から抽出したDNAを用いて最適だと導き出した組み合わせで行った。その結果、簡易抽出では、モバイル型、ベンチトップ型のいずれの装置でも検出されず、高純度精製によるもののみ検出された。簡易抽出は阻害物質の影響で検出されなかった可能性があるため、阻害物質除去剤を使用したところ、モバイル型・ベンチトップ型いずれの装置でも検出されなかった。そこで、サンプルの希釈溶液によるqPCRを行ったところ、池のサンプルのみモバイル型・ベンチトップ型いずれの装置でも検出された。③産卵時期を迎えたアベサンショウウオの環境水を採水しフィルターろ過、現場ろ過した環境水サンプルをモバイル型・ベンチトップ型qPCRで環境DNA検出を行った結果、実験室でフィルターろ過したもののみで検出された。但し、簡易な検出手法の確立からは遠ざかってしまう結果なので、今後は更なる簡易抽出法を試してみる必要がある。
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環境 DNA を用いた滑川町におけるドブガイ類の生息する谷津沼の検索
利用环境 DNA 寻找滑川町褐蜗牛栖息的八须磨沼泽
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[石黒 直哉, 石田 美咲乃]
通讯作者:
石田 美咲乃
モバイル PCR 装置を用いた簡便かつ迅速なアベサンショウウオ (Hynobius abei)の環境 DNA 検出手法の確立
建立使用移动PCR装置检测阿部蝾螈(Hynobius abei)环境DNA的简单快速方法
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ishiguro N, Jinno K, Saito T, Kato H, 松本佑介・山本佐江・草原和博, 石黒直哉,高山晃徳,齊藤達也,金澤光, 石黒直哉,加藤優斗,中澤秀道, 真加部湧大・篠原嶺・村上聡恵・大坂遊, 日和佳政,戸井田和希,石黒直哉]
通讯作者:
日和佳政,戸井田和希,石黒直哉
Establishment of a detection system for the invasive species Chelydra serpentina using environmental DNA
利用环境DNA建立入侵物种蛇纹龟检测系统
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
DNA鑑定
影响因子:
--
作者:
[Ishiguro N, Jinno K, Saito T, Kato H]
通讯作者:
Kato H
城西大学理学研究科物質科学専攻環境生命化学研究室 紹介動画
城西大学研究生院理学部材料学部环境生物化学实验室介绍视频
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
環境DNA分析による入間川支流のホトケドジョウの生息地調査
利用环境 DNA 分析对入间川支流鲅鱼栖息地进行调查
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
野生復帰
影响因子:
--
作者:
[鈴木慎一朗, 上岡蓮,安田慎吾,伊藤陽介, 石黒直哉・加藤優斗]
通讯作者:
石黒直哉・加藤優斗
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