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Structural probing of RNA G-quadruplex structures in vivo

Structural probing of RNA G-quadruplex structures in vivo
体内 RNA G 四链体结构的结构探测
批准号：
21K05314
负责人：
石塚 匠
金额：
$2.75万
依托单位：
University of Miyazaki
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K05314/
关键词：
グアニン四重鎖構造RNAセリウムグアニン四重鎖

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本研究は、RNAグアニン四重鎖構造(rG4)をヌクレオチドレベルの分解能で検出可能な技術を開発することを目標としている。前年度まで、Ce(IV)/EDTAを用いたrG4を標的とする構造解析法を確立した。本年度においては、開発した構造解析法の実用性および汎用性を評価するため、テロメアRNA配列や神経変性疾患におけるリピート配列、mRNAおよび5’UTRにおける配列で形成されるrG4構造に対して本手法を応用した。また、rG4選択性を検証するため、ヘアピン、バルジやインターナルループ構造を有するRNA配列においても検討した。その結果、形成される構造により切断効率が異なることが明らかとなり、rG4選択的に解析できることを実証した。さらに、Ce(IV)/EDTAよるrG4の部位特異的切断の切断機構を明らかにするため、質量分析法により切断断片を調査した。その結果、ホスホジエステル結合は、加水分解的に3’および5’側の両側で起こることが確認された。さらなる詳細に関しては現在解析中である。
期刊论文(12)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
蛍光共鳴エネルギー移動（FRET)を利用したin situ hybridization法
使用荧光共振能量转移（FRET）的原位杂交方法
DOI： --
发表时间： 2022
期刊：
影响因子： --
作者： [石塚 匠, Narantsog Choijookhuu, 柴田 恭明, 徐 岩, 小路 武彦, 菱川 善隆]
通讯作者： 菱川 善隆
In situ hybridization法
原位杂交法
DOI： --
发表时间： 2022
期刊：
影响因子： --
作者： [菱川 善隆, Narantsog Choijookhuu, 石塚 匠, 柴田 恭明, 小路 武彦]
通讯作者： 小路 武彦
マウス卵巣における HMGB2 の卵胞形成への関与
HMGB2 参与小鼠卵巢卵泡发生
DOI： --
发表时间： 2022
期刊：
影响因子： --
作者： [山隈 優, Narantsog Choijookhuu, 甲斐 健吾, Fidya, 白水　慎一郎, 石塚 匠, 菱川 善隆]
通讯作者： 菱川 善隆
病理と臨床
病理学和临床
DOI： --
发表时间： 2022
期刊：
影响因子： --
作者： [菱川　善隆, Narantsog Choijookhuu, 石塚　匠, 柴田　恭明, 小路　武彦]
通讯作者： 小路　武彦
共 10 条
    精子形成過程から解明するグアニン四重鎖構造の生物学的機能
    • 批准号：
      24K08641
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.91万
    • 财政年份：
      2024
    • 负责人：
      石塚 匠
    • 依托单位：
      University of Miyazaki
    PNA/DNAグアニン四重鎖形成および蛍光性クリック反応の拡張と応用
    PNAを応用した遺伝子工学ツールの拡張および二本鎖DNAを認識する新規分子の開発
    • 批准号：
      09J01812
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额：
      $0.9万
    • 财政年份：
      2009
    • 负责人：
      石塚 匠
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    国内基金
    海外基金
    免标记CRISPR-RNA适配体与门逻辑分子诊断新方法研究
    • 批准号：
      2026JJ50010
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      应站明
    • 依托单位：
      湘潭大学
    RNA m6A修饰通过调控FDX1介导的铜死亡参与补阳还五汤抗脑缺血再灌注损伤作用机制的研究
    • 批准号：
      2026JJ81091
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      刘亮
    • 依托单位：
      宁乡市人民医院
    基于合成生物标志物的超多重RNA数字化检测平台用于肿瘤精准诊断和分期评估
    • 批准号：
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      程子译
    • 依托单位：
      海南医科大学
    RNA 结合蛋白HuR与VEGF-D联合调控舌鳞癌侵袭及转移机制的研究
    • 批准号：
      2026JJ80684
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      龚攀
    • 依托单位：
      张家界市人民医院