体サイズの進化：平行進化は同じ遺伝子で生じるのか？

大型マイマイカブリ亜種と小型マイマイカブリ亜種間の体サイズに関する遺伝子座数の推定精度を上げるため、量的遺伝解析方法と形態測定方法の改善を行った。具体的には、形態測定値に対し母性効果や雌雄体サイズ差を考慮した測定値の補正を行うとともに、測定値の幾何平均を体サイズ値として用いる形態解析法を適用した。以上の解析方法の変更後、再度、joint-scaling法に基づく相加遺伝効果と優性効果の推定、またCastle-Wright法による関連遺伝子座数の推定を行った。その結果、少数の遺伝子座が大型マイマイカブリ亜種と小型マイマイカブリ亜種間の体サイズに関与しているということを、再度、確認することができた。この結果は、マイマイカブリの体サイズ進化において少数の主要遺伝子が関与している可能性を示唆している。実際に上記の体サイズ遺伝子を特定する上ではQTLマッピング等で体サイズの遺伝領域を特定するだけでなく、遺伝領域内の候補遺伝子を絞り込む必要がある。遺伝子発現解析などのトランスクリプトーム解析が候補遺伝子を絞り込む上で有効であるが、その際、体サイズ差を起因する発生ステージを特定することが重要となる。そこで、上記の実験に用いた大型マイマイカブリと小型マイマイカブリ、およびF1集団と戻し交雑集団の各発生ステージ期間を比較した。その結果、体サイズ差を生み出している複数の発生ステージを特定することができた。マイマイカブリ亜種間の体サイズ差を生み出している遺伝領域の特定を目的にリシーケンス解析も行った。マイマイカブリの野生個体37集団からDNAを抽出し、全ゲノムランダムショットガンシーケンスを行った。その結果、合計33億リード、494Gbpの塩基配列を獲得することができた。

大型マイマイカブリ亜種と小型マイマイカブリ亜種間の体サイズに関する遺伝子座数の推定精度を上げるため、量的遺伝解析方法と形態測定方法の改善を行った。具体的には、形態測定値に対し母性効果や雌雄体サイズ差を考慮した測定値の補正を行うとともに、測定値の幾何平均を体サイズ値として用いる形態解析法を適用した。以上の解析方法の変更後、再度、joint-scaling法に基づく相加遺伝効果と優性効果の推定、またCastle-Wright法による関連遺伝子座数の推定を行った。その結果、少数の遺伝子座が大型マイマイカブリ亜種と小型マイマイカブリ亜種間の体サイズに関与しているということを、再度、確認することができた。この結果は、マイマイカブリの体サイズ進化において少数の主要遺伝子が関与している可能性を示唆している。実際に上記の体サイズ遺伝子を特定する上ではQTLマッピング等で体サイズの遺伝領域を特定するだけでなく、遺伝領域内の候補遺伝子を絞り込む必要がある。遺伝子発現解析などのトランスクリプトーム解析が候補遺伝子を絞り込む上で有効であるが、その際、体サイズ差を起因する発生ステージを特定することが重要となる。そこで、上記の実験に用いた大型マイマイカブリと小型マイマイカブリ、およびF1集団と戻し交雑集団の各発生ステージ期間を比較した。その結果、体サイズ差を生み出している複数の発生ステージを特定することができた。マイマイカブリ亜種間の体サイズ差を生み出している遺伝領域の特定を目的にリシーケンス解析も行った。マイマイカブリの野生個体37集団からDNAを抽出し、全ゲノムランダムショットガンシーケンスを行った。その結果、合計33億リード、494Gbpの塩基配列を獲得することができた。