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体サイズの進化：平行進化は同じ遺伝子で生じるのか？

身体尺寸的进化：相同基因是否发生平行进化？

基本信息

批准号：
21K06340
负责人：
小沼順二
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Toho University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

大型マイマイカブリ亜種と小型マイマイカブリ亜種間の体サイズに関する遺伝子座数の推定精度を上げるため、量的遺伝解析方法と形態測定方法の改善を行った。具体的には、形態測定値に対し母性効果や雌雄体サイズ差を考慮した測定値の補正を行うとともに、測定値の幾何平均を体サイズ値として用いる形態解析法を適用した。以上の解析方法の変更後、再度、joint-scaling法に基づく相加遺伝効果と優性効果の推定、またCastle-Wright法による関連遺伝子座数の推定を行った。その結果、少数の遺伝子座が大型マイマイカブリ亜種と小型マイマイカブリ亜種間の体サイズに関与しているということを、再度、確認することができた。この結果は、マイマイカブリの体サイズ進化において少数の主要遺伝子が関与している可能性を示唆している。実際に上記の体サイズ遺伝子を特定する上ではQTLマッピング等で体サイズの遺伝領域を特定するだけでなく、遺伝領域内の候補遺伝子を絞り込む必要がある。遺伝子発現解析などのトランスクリプトーム解析が候補遺伝子を絞り込む上で有効であるが、その際、体サイズ差を起因する発生ステージを特定することが重要となる。そこで、上記の実験に用いた大型マイマイカブリと小型マイマイカブリ、およびF1集団と戻し交雑集団の各発生ステージ期間を比較した。その結果、体サイズ差を生み出している複数の発生ステージを特定することができた。マイマイカブリ亜種間の体サイズ差を生み出している遺伝領域の特定を目的にリシーケンス解析も行った。マイマイカブリの野生個体37集団からDNAを抽出し、全ゲノムランダムショットガンシーケンスを行った。その結果、合計33億リード、494Gbpの塩基配列を獲得することができた。

The accuracy of the estimation of the number of loci between large and small species was improved. The method of morphological analysis is applicable to the determination of the difference between male and female. The above analysis methods are modified, re-evaluated, joint-scaling method, estimation of additive effect, estimation of optimal effect, and estimation of number of related loci by Castle-Wright method. The result is that a small number of species have been identified. The results show that there are a few major genetic factors involved in the evolution of the genome. In fact, QTL is required to identify the candidate genes in the gene domain of the gene domain. The analysis of the occurrence of the candidate gene is important because it is the cause of the difference between the two genes. A comparison of the development periods of the F1 group. The result is that there are several different ways to generate information. The difference between the species and the domain is analyzed. 37 groups of wild individuals were isolated, and all of them were isolated. The results, totaling 3.3 billion, 494Gbp of base alignment were obtained.