Molecular characterization and therapeutic target identification of gastric cancer with primitive phenotype

原始表型胃癌的分子特征及治疗靶点鉴定

• 批准号: 21K06882
• 负责人: 牛久 哲男
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06882/
• 关键词: 胃癌; 胎児形質; ゲノム異常; 治療標的

これまでの共同研究で実施されたRNA-seqデータが得られている大規模胃癌コホートから、胎児形質関連遺伝子発現の亢進している一群を抽出した。この群で特徴的に高発現しているがん関連遺伝子についてタンパクレベルでの発現を確認するため、同コホートの180例の胃癌について免疫組織化学的染色によるタンパク発現の評価を行った。胎児形質胃癌の一部については、Visium空間的遺伝子発現解析プラットフォームを用いて腫瘍内における各遺伝子発現の不均一性や組織像との対応について詳細な評価を行った。代表的な胎児形質型胃癌の臨床検体の凍結組織を用いて、ATAC-seqを用いたエピゲノム解析、および全ゲノムシーケンス解析を進めている。これらの解析を通して、胎児形質胃癌の発生・進展過程におけるゲノム異常、エピゲノム異常、遺伝子発現プロファイルの変化を統合的に理解し、どのような因子が高悪性度形質に関与しているのか、その分子メカニズムの解明に向けてさらに解析を進めている。またこれらの解析を通して、胎児形質胃癌に有効な治療戦略の確立に向けた基盤データを提供し、また新たな治療介入ポイントの探索を行っている。胎児形質胃癌に対する免疫チェックポイント阻害薬の効果については現時点ではほとんど報告がなく明らかになっていないため、PD-L1発現やHLA-classI分子の発現異常、CD8陽性T細胞浸潤、TMBなどの効果予測マーカーについて検討を行い、この高悪性度胃癌における免疫微小環境の理解、免疫療法の適応可能性についても解析を進めている。

This joint study was conducted to extract a group of RNA-seq genes from large-scale gastric cancer, and the development of fetal quality-related genes. The presence of these features was confirmed by immunohistochemical staining in 180 cases of gastric cancer. A part of fetal gastric cancer is characterized by heterogeneities in gene expression in visible-space, and detailed evaluation of tissue images. The frozen tissue analysis and ATAC-seq analysis of typical pediatric gastric cancer clinical specimens were carried out. The analysis of these factors is related to the development and progression of fetal gastric cancer. The analysis of these factors is related to the development and progression of fetal gastric cancer. The analysis of these factors is related to the development and progression of fetal gastric cancer. The analysis of fetal gastric cancer has been carried out to establish a treatment strategy for the treatment of fetal gastric cancer, to provide a new treatment intervention strategy for fetal gastric cancer, and to explore the treatment strategy for fetal gastric cancer. The study on the effect of immunosuppressive agents on fetal gastric cancer, the understanding of immune microenvironment and the analysis of the possibility of immunotherapy are in progress.

项目成果

Multiancestry genomic and transcriptomic analysis of gastric cancer

• DOI: 10.1038/s41588-023-01333-x
• 发表时间: 2023-03
• 期刊: Nature Genetics
• 影响因子: 30.8
• 作者: Y. Totoki;Mihoko Saito-Adachi;Y. Shiraishi;D. Komura;Hiromi Nakamura;Akihiro Suzuki;K. Tatsuno;Hirofumi Rokutan;Natsuko Hama;Shogo Yamamoto;Hanako Ono;Y. Arai;F. Hosoda;H. Katoh;K. Chiba;N. Iida;G. Nagae;Hiroki Ueda;Shihang Chen;S. Sekine;Hiroyuki Abe;S. Nomura;Tetsuya Matsuura;E. Sakai;T. Ohshima;Y. Rino;K. Yeoh;J. So;Kaushal Sanghvi;R. Soong;A. Fukagawa;S. Yachida;Mamoru Kato;Y. Seto;T. Ushiku;A. Nakajima;H. Katai;P. Tan;S. Ishikawa;H. Aburatani;T. Shibata

高悪性度胃癌の分子病理学的特徴

高级别胃癌的分子病理特征

• 发表时间: 2022
• 期刊: 胃と腸
• 作者: 小林祐斗;森島良貴;辻尚樹;福田亮介;及川大輔;徳永文稔;沖米田司;牛久哲男
• 通讯作者: 牛久哲男

ゲノム医療の基礎と実際

基因组医学基础与实践

• 发表时间: 2023
• 作者: Ichimata Shojiro;Katoh Nagaaki;Abe Ryuta;Yoshinaga Tsuneaki;Kametani Fuyuki;Yazaki Masahide;Kusama Yukiko;Sano Kenji;Uehara Takeshi;Sekijima Yoshiki;牛久哲男
• 通讯作者: 牛久哲男

東京大学人体病理学・病理診断学分野ホームページ

东京大学人类病理学与病理诊断学系主页

Carcinosarcoma of the stomach: four cases that expand the morphologic spectrum of gastric cancer with a primitive phenotype

• DOI: 10.1007/s00428-022-03307-6
• 发表时间: 2022-03-03
• 期刊: VIRCHOWS ARCHIV
• 影响因子: 3.5
• 作者: Yamazawa，Sho;Ushiku，Tetsuo
• 通讯作者: Ushiku，Tetsuo