Molecular characterization and therapeutic target identification of gastric cancer with primitive phenotype

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これまでの共同研究で実施されたRNA-seqデータが得られている大規模胃癌コホートから、胎児形質関連遺伝子発現の亢進している一群を抽出した。この群で特徴的に高発現しているがん関連遺伝子についてタンパクレベルでの発現を確認するため、同コホートの180例の胃癌について免疫組織化学的染色によるタンパク発現の評価を行った。胎児形質胃癌の一部については、Visium空間的遺伝子発現解析プラットフォームを用いて腫瘍内における各遺伝子発現の不均一性や組織像との対応について詳細な評価を行った。代表的な胎児形質型胃癌の臨床検体の凍結組織を用いて、ATAC-seqを用いたエピゲノム解析、および全ゲノムシーケンス解析を進めている。これらの解析を通して、胎児形質胃癌の発生・進展過程におけるゲノム異常、エピゲノム異常、遺伝子発現プロファイルの変化を統合的に理解し、どのような因子が高悪性度形質に関与しているのか、その分子メカニズムの解明に向けてさらに解析を進めている。またこれらの解析を通して、胎児形質胃癌に有効な治療戦略の確立に向けた基盤データを提供し、また新たな治療介入ポイントの探索を行っている。胎児形質胃癌に対する免疫チェックポイント阻害薬の効果については現時点ではほとんど報告がなく明らかになっていないため、PD-L1発現やHLA-classI分子の発現異常、CD8陽性T細胞浸潤、TMBなどの効果予測マーカーについて検討を行い、この高悪性度胃癌における免疫微小環境の理解、免疫療法の適応可能性についても解析を進めている。