時系列的なマイクロ進化を加味した院内感染疫学の新手法開発に関する研究

考虑时间微进化的医院感染流行病学新方法的开发研究

• 批准号: 21K07014
• 负责人: 河村 好章
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Aichi Gakuin University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K07014/
• 关键词: CRISPR; マイクロ進化; 時系列; 院内感染; 疫学解析

東京の１つの病院からの多数のHelicobacter cinaedi分離株については、すでに１００株以上を受領している。そのうち９９株については、whole genomeのドラフト解析を終了することができた。今後、これらのデータを使って、分離年月日の順番や、分離病棟をはじめとした臨床背景（この情報については、まだ病院側から受領しておらず、情報提供待ちである。）および、これまで使用してきたCRISPR配列に基づく、進化系統を確認し、同じ方向性を持って進化（または変異の蓄積）を示す遺伝子を探索したい。なお、本研究を推進する過程で、ヒトから分離されるHelicobacter属菌種で、既存の菌種に当てはまらない株があることが明らかとなり、Helicobacter kumamotonensisとの名称をつけ、分類学的に正式に発表することができた。本研究のため、遺伝子を詳細に解析する事に拠り、新菌種の発見に繋げることができたと考えている。またヒト臨床に於いてはHelicobacter属菌が見いだされると、ほとんどH. cinaediであると考えらえてしまうが、分類学的に異なる菌種が存在する事、それらを正規のH. cinaediと区別する事に拠り、H. cinaediの疫学解析の精度を挙げることにも貢献できたと考えている。本成果について、アメリカ微生物学会(ASM)およびヨーロッパ微生物学会(FEMS)にて発表し、世界的に周知を行う予定である。

Most of the isolates of Helicobacter cinaedi were collected from Tokyo Hospital and more than 100 strains were collected. 99 strains, whole genomes, and analysis of the end of the world In the future, the disease will be separated from the clinical background. CRISPR alignment, identification of evolutionary systems, consistent directional evolution (accumulation of diversity), and exploration of genetic resources The process of advancing this study includes the isolation of Helicobacter species, the identification of existing species, the name of Helicobacter kumamotonensis, and the formal taxonomic presentation. In this study, we analyzed the development of new strains in detail. The clinical characteristics of Helicobacterium species are as follows: cinaedi cinaedi The accuracy of cinaedi's epidemiological analysis is very high. The results of this study are published in the Society for Microbiology (ASM) and published in the Society for Microbiology (FEMS).

项目成果

Phylum(門)の国際原核生物命名規約への組込みおよび42門の承認名の公表ー関連する命名規約の変更情報等についてー

将门（phylum）纳入《国际原核生物命名法典》并公布 42 个门的批准名称 - 相关命名规则变更信息 -

• 发表时间: 2022
• 作者: 猪飼まりえ;熊懐香葉;平田 直;藤井 萌;坂入孔明;美間健彦;森田雄二;佐藤綾人;港 雄介;河村好章
• 通讯作者: 河村好章

Helicobacter cinaediの超硫黄代謝を介した持続的な骨髄内感染機構の解明

华人螺杆菌超硫代谢介导的持续性髓内感染机制的阐明

• 发表时间: 2023
• 作者: 松永哲郎;守田匡伸;西村 明;井田智章;澤 智裕;本橋ほづみ;河村好章;赤池孝章
• 通讯作者: 赤池孝章

Helicobacter kumamotonensis sp. nov., isolated from human clinical specimens

• DOI: 10.1099/ijsem.0.005732
• 发表时间: 2023-01-01
• 期刊: INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY
• 影响因子: 2.8
• 作者: Kawamura，Yoshiaki;Fujimoto，Yuko;Sawa，Tomohiro
• 通讯作者: Sawa，Tomohiro

Helicobacter cinaediの薬剤感受性の現状と再発株の遺伝学的解析について

胃螺杆菌药敏现状及复发菌株遗传分析

• 发表时间: 2022
• 作者: 芳賀美友;富田純子;久綱僚;遠藤勇祐;馬場勝;荒岡秀樹;河村好章
• 通讯作者: 河村好章

Helicobacter cinaediにおける特異的遺伝子群の探索およびVI型分泌装置の機能解析

胃螺杆菌VI型分泌器特异基因群的寻找及功能分析

• 发表时间: 2022
• 作者: 富田純子;久綱僚;河村好章
• 通讯作者: 河村好章