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APEX multi-labels, large field 3D electron microscopy analysis for highly dense brain networks

APEX multi-labels, large field 3D electron microscopy analysis for highly dense brain networks
APEX 多标记、大视场 3D 电子显微镜分析高密度大脑网络
批准号:
21K07254
负责人:
滋野 修一
金额:
$2.75万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2023-03-31

项目摘要

项目成果

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本研究が設定した段階的な進展の内、達成した内容を要約する。(1)走査型電子顕微鏡で可視化できる電子タグAPEXマルチラベル手法をマウス脳の線条体に適用し、広域のダイヤモンドナイフとテープ上での連続超薄切片撮影と大量画像の一括モンタージュ、アライメント、画像処理を完成。レンダリング処理を用いた立体構築により、シナプス、スパインや回路を識別、骨格もしくはレンダリング三次元モデルを作成することに成功した。(2)大脳皮質の体性感覚野S1領域における第5層のニューロンを対象に、APEXをミトコンドリアで局所発現、また同個体の脳で、大脳皮質運動野の第5層の細胞体の細胞質にAPEXを局所的に発現、線条体腹側部で、大脳皮質二箇所から投射する長距離性の回路を二重標識した。さらに(3)発達期の脳を用いて、固定法や染色条件について改良を加えることにより、子宮内電気細孔法でも標本作成と観察が成功した。また、APEXで標識された回路を手動もしくは自動で機械認識させる技術の発達を試みた。この手法は、複雑な回路の識別時間を大幅に短縮することが可能である。既に大脳皮質で報告のある3D U-netやFlood filling networkを用いて線条体ので回路を機械学習させ、軸索と樹状突起を機械識別させることに成功した。研究の主目的である、D1もしくはD2タイプのドーパミン受容体を発現する線条体中型有棘細胞群の相互連結を識別し、その結合特性を解明した結果、これまで視床で同定されている巨大シナプスが豊富に存在していることを発見した。さらに本手法の優位点である全結合同定を行い、シナプス周辺の結合回路を全同定し、複数の細胞タイプが、単一シナプス場に情報連結する新しい像を得ることができた。
期刊论文(5)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
A multi-scale APEX electron tag 3D-electron microscopy and synchrotron X-ray analyses of the mouse cortico-striatal circuits
小鼠皮质纹状体回路的多尺度 APEX 电子标签 3D 电子显微镜和同步加速器 X 射线分析
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [Shigeno S, Sampathkumar. V, Oka Y, Vescovi R, Hanyu L, Uram T, Ferrier N, Sato M, Kasthuri NB]
通讯作者: Kasthuri NB
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [滋野修一, V. Sampathkumar, N. Kasthuri, 岡雄一郎, 佐藤真]
通讯作者: 佐藤真
国内基金
海外基金
替尼泊苷抑制APEX1驱动DNA损伤在治疗肺癌中的作用及机制研究
  • 批准号:
    JCZRYB202500477
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2025
  • 负责人:
  • 依托单位:
APEX1/Jaggd1/Notch介导的碱基切除修复在胆囊癌中的作用及机制研究
  • 批准号:
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2025
  • 负责人:
    冯一浮
  • 依托单位:
APEX1调控p53/p21信号通路通过缓解软骨细胞衰老延缓创伤性骨关节炎的机制研究
  • 批准号:
    2025JJ80999
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2025
  • 负责人:
    何春荣
  • 依托单位:
利用基于 APEX2 邻位标记的蛋白质组学研究 新化合物 GW 调节非酒精性脂肪肝病的分子 机制