罹患組織の単細胞RNAシーケンス解析を起点としたIgG4関連疾患の病態の解明

基于受影响组织的单细胞 RNA 序列分析阐明 IgG4 相关疾病的病理学

• 批准号: 21K08436
• 负责人: 池田 啓
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Chiba University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K08436/
• 关键词: IgG4関連疾患; 単細胞RNAシークエンス; 顎下腺; コラーゲン; バイオマーカー; 疾患特異的細胞; 単細胞RNAシーケンス; 罹患組織

IgG4関連疾患(IgG4-RD)患者3例ならびに非自己免疫性疾患(コントロール)患者3例の顎下腺の生検検体を採取し、血球系細胞(CD45+) および非血球系細胞 (CD45-) を、フローサイトメトリーを用いて単離、また同症例の末梢血単核球(PBMC)を分離し、それぞれscRNA-seq解析 (10x Genomics) を実施した。顎下腺検体において、IgG4-RD1例は検体不良により除外、コントロール1例は病理組織上炎症所見を認め不適切症例と考え除外、それぞれ2例ずつの検体を比較解析した。その結果、IgG4-RD群で特定の血球系細胞群が増加していた。また、IgG4-RDでは線維芽細胞における特定のタイプのコラーゲン遺伝子の発現が上昇していることが分かり、組織の免疫染色においても当該のコラーゲン蛋白の発現上昇が確認された。さらにIngenuity Pathway Analysis (IPA)により、その2つの現象の関連を示す仮説が立てられた。仮説検証のため、免疫染色、細胞株を用いた解析を実施中である。上記患者とは別に、治療開始あるいは治療強化前のIgG4-RD患者10例を前向きコホートに組み入れ、臨床情報と血球・血清検体を収集した。またコントロール群として未治療シェーグレン症候群2例、健常者2例の血球・血清検体を保存し、バイオマーカー解析の準備をしている。

IgG4 masato disorders (IgG4 - RD) 3 patients with な ら び に the oneself immunity disease (コ ン ト ロ ー ル) 3 patients with の born under the jaw gland の 検 検 を take し, blood cells (CD45 +) お よ び not blood cells (CD45 -) を, フ ロ ー サ イ ト メ ト リ ー を with い て 単 from, ま た cases with 単 nuclear ball (PBMC) を の peripheral blood separation し, そ れ ぞ れ scRNA - seq parsing (10 x Genomics) を be applied し た. 検 under jaw gland body に お い て, IgG4 - RD1 は 検 body bad に よ except り, コ ン ト ロ ー ル 1 case of pathological tissue inflammation seen は を recognize め cases not appropriate と exam except え, そ れ ぞ れ 2 cases ず つ の 検 body を comparative analytic し た. Youdaoplaceholder0 そ result, IgG4-RD group で specific <s:1> hematopoietic cell population が increased <s:1> て た た た. ま た, IgG4 - RD で は line d bud cells に お け る specific の タ イ プ の コ ラ ー ゲ ン posthumous son 伝 の 発 now rising が し て い る こ と が points か り, organization の immune dyeing に お い て も when the の コ ラ ー ゲ ン protein の 発 now rising が confirm さ れ た. さ ら に Ingenuity Pathway Analysis (IPA) に よ り, そ の 2 つ の phenomenon の masato even を shown す 仮 said が て ら れ た. Youdaoplaceholder0 said that 検 syndrome <s:1> ため, immunostaining, cell line を using た た analysis を in practice である. Patients with written と は don't に, treatment start あ る い は treatment before strengthening の IgG4-10 patients with RD を forward き コ ホ ー ト み into れ に group, clinical information と, blood serum, 検 body を 収 set し た. ま た コ ン ト ロ ー ル group と し て untreated シ ェ ー グ レ ン syndrome in 2 cases, the health is often 2 cases の, blood serum, 検 を save し, バ イ オ マ ー カ ー parsing の prepare を し て い る.