革新的治療法開発を目指した食道胃接合部腺癌の網羅的ゲノム解析

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本研究の目的は、術前化学放射線療法により組織学的完全奏功をした症例と治療に対して抵抗性を示した症例をExome/RNA sequencingを用いて比較することで、治療感受性に基づいた網羅的なゲノム解析を行うことである。MD Anderson Cancer Centerで術前治療として化学放射線療法がおこなわれて手術された症例で組織学的完全奏功をした症例20例と治療抵抗性を示した症例20例の治療前凍結組織よりDNAとRNAを採取した。DNAとRNAのクオリティーチェックを行い、NovaSeq6000を用いたExome/RNA sequencingを行った。組織学的完全奏功を得られた症例で再発した症例と再発しなかった症例のゲノムを比較すると再発症例で有意に増加している遺伝子が７４種類、再発しなかった症例で有意に増加している遺伝子が２３種類が同定された。その中から予後や奏効率に強く関与している遺伝子を同定しシークエンス、qRT-PCR、免疫組織化学染色等の方法を行い、多数例の臨床サンプルを用いて検討する予定である。