Bile cell-free DNAを用いゲノム多様性を標的にした胆道癌新規治療

利用胆汁游离 DNA 靶向基因组多样性的胆道癌新疗法

• 批准号: 21K08748
• 负责人: 中川 圭
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K08748/
• 关键词: 胆道癌; 胆汁; ct-DNA; cfDNA; ゲノム変異

近年のゲノム解析技術の進歩により、胆道癌の全ゲノム解析の結果が報告され、胆道癌は多種多様な遺伝子変異を持ちheterogeneousな遺伝子背景が特徴である。胆道癌の約40%において、新規治療の対象となりうるactionableな変異を有していると言われており、遺伝子変異に則した個別化医療が期待されている。また、遺伝子変異の蓄積はfounder cellと併存可能な多数のsubcloneを生み、その一つが転移巣を形成する。さらに治療過程において、治療抵抗性を持つsubcloneを生じ、癌の再増悪を来たす。このような癌のクローン進化を追随することができれば、遠隔転移巣への治療介入や治療耐性克服のための新規治療に貢献できる。ゲノム解析を軸とした新規バイオマーカーとして、circulating tumor DNA (ct-DNA)が注目されている。血中ct-DNAとは細胞死により血中に漏れ出た癌細胞由来DNAの一部であり、①病勢を反映する新たなバイオマーカーとして、または、②個別化医療や治療抵抗性に関わるゲノム情報として、有用性が報告されている。しかし一方で、課題は多い。特に胆道癌は間質の豊富な癌であるため、血中ct-DNA陽性率が低く、heterogenousな遺伝子背景を有する胆道癌は、fragmentの小さいct-DNAでは遺伝子変異の全容を明らかにすることは困難である。本研究では新たなリキットバイオプシーとして、胆汁中のcf-DNAに注目した。胆汁内には癌細胞が直接こぼれ落ちるため、胆汁中cf-DNAは fragmentの長いより良質のDNAを大量に抽出でき、血中ct-DNAに比べゲノム解析サンプルとして有用である可能性が高いことが示唆された。

In recent years, the progress of analysis technology, the results of complete analysis of biliary tract cancer are reported, and the characteristics of biliary tract cancer are different from that of heterogeneous gene background. About 40% of biliary tract cancer patients are expected to receive actionable treatment. The accumulation of genetic diversity in founder cells and co-existence of multiple subclones may lead to the formation of genetic diversity. During the treatment process, treatment resistance continues to subclone, and cancer growth continues. The evolution of cancer is followed by treatment, intervention and tolerance. The analysis of tumor DNA (ct-DNA) is based on new regulations. The blood ct-DNA is leaked out of the blood, and the disease is reflected in the new information. One side, many topics. In particular, biliary tract cancer is rich in stroma, and ct-DNA positive rates in blood are low and heterogeneous. This study focuses on cf-DNA in bile. Cf-DNA in bile is extracted in large quantities from fragments, and ct-DNA in blood is more likely to be analyzed and useful.