ゲノム、エピゲノム統合解析による低侵襲潰瘍性大腸炎癌化リスク診断法の開発

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本研究は潰瘍性大腸炎の癌化に関与する既知のgenetic異常ならびに網羅的に解析したepigenetic異常を解析し、大腸癌合併潰瘍性大腸癌患者を早期診断可能とする体液を用いた低侵襲なバイオマーカー開発を目標としている。また、epigenetic異常であるDNAメチル化、 miRNAに着目することでそれにより制御される遺伝子発現に着目し、新たな潰瘍性大腸炎癌化のメカニズムを解明することで、新たな治療戦略を確立し、潰瘍性大腸炎患者の予後・QOLの向上を目指すことを目標としている。研究方法として、潰瘍性大腸炎患者の癌部、非癌部ならびに大腸癌合併UC患者のUC大腸粘膜ならびに癌部と大腸癌患者の正常大腸粘膜ならびに癌部から採取した凍結生標本よりDNAを抽出し、それぞれの群のDNAを用いて網羅的DNAメチル化解析を行い、UC大腸癌部ならびに大腸癌部で共通に高メチル化している癌化関連CpGサイトAを同定した。当該年度は同定した癌化関連CpGサイトAの潰瘍性大腸炎の大腸粘膜におけるメチル化の意義を当科で施行した手術サンプルを用いて検討した。その結果として大腸粘膜のメチル化は大腸の口側から肛門側に至るにつれメチル化レベルが高くなることが示された。また、発症時年齢、手術時年齢が高い症例でメチル化レベルが有意に高値で、病脳期間が長い症例も有意に高値であった。また潰瘍性大腸炎の癌部と非癌部では有意に癌部でメチル化レベルが高く、このCpGサイトAのメチル化はAgingならびに発癌に関連することが示された。