泌尿器癌における全血RNAを用いた免疫細胞の多様性の理解と治療効果予測への応用

利用全血 RNA 了解泌尿系癌症中免疫细胞的多样性及其在预测治疗效果中的应用

• 批准号: 21K09365
• 负责人: 小島 崇宏
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Aichi Cancer Center Research Institute
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K09365/
• 关键词: トランスクリプトーム解析; 免疫治療; バイオマーカー; RNA

昨年度のRNAシークエンスが完了していた腎癌患者19例の予備解析に引き続き、今年度はさらに30例の腎癌患者の全血RNAシークエンスを行い、合計49例で追加解析を行った。イピリムマブ+ニボルマブ群は19例、ニボルマブ群は14例であった。奏効性における最大の差を明らかにするために、RECISTのSD症例を除いた合計33例のトレーニングコホートで、奏効群（CR+PR）と非奏効群（PD）とで発現変動遺伝子（DEG）解析を行った。抽出された460個の免疫応答経路に関連するDEGを用いて教師なし階層型クラスタリングを行った結果、奏効率が大きく異なる2つのクラスター形成を認めた。最短収縮重心法を用い、460個のDEGから14個の最小遺伝子セットを作成したところ、感度94.7%、特異度50.0%で奏効群を分類することが可能であった。最後に、DEG解析から除外したSD患者16例を追加した合計49例のバリデーションコホートで、14遺伝子セットのパフォーマンスを評価した結果、階層型クラスタリングよりも統計学的堅牢性が高いコンセンサスクラスタリングにて、奏効率が95.8% vs. 48.0%と顕著に異なるクラスター形成が再現性をもって可能であることを明らかとした。以上の結果より、免疫チェックポイント阻害剤で治療された腎癌患者の全血遺伝子発現プロファイルは奏効性によって明瞭に異なり、免疫応答経路に関連するDEGを用いたクラスタリングにより奏効群を正確に分類できることが明らかとなった。

Yesterday's annual の RNA シ ー ク エ ン ス が finished し て い た 19 patients with kidney cancer の reserve parsing に lead き 続 き, our は さ ら に の all 30 patients with の kidney blood RNA シ ー ク エ ン ス を い, total 49 cases で additional parsing line を っ た. Youdaoplaceholder0 ピリム ブ ブ+ニボ ブ ブ ブ group ブ 19 cases, ニボ ニボ ブ ブ ブ であった であった group であった 14 cases であった. Played sharper sex に お け る maximum differential の を Ming ら か に す る た め に cases, RECIST の SD を except い た total 33 cases の ト レ ー ニ ン グ コ ホ ー ト で, play working group (CR + PR) と not play working group (PD) と で 発 now - move legacy 伝 child line (DEG) analytic を っ た. Spare さ れ た 460 の immune 応 answer 経 road に masato even す る DEG を with い て teachers な し class type ク ラ ス タ リ ン グ を line っ た results, big play sharper rate が き く different な る 2 つ の ク ラ ス タ ー form を recognize め た. Shortest 収 shrinkage gravity method を い, 460 の DEG か ら 14 の minimum heritage 伝 son セ ッ ト を made し た と こ ろ, sensitivity 94.7%, 50.0%, specific で す を working group classification played る こ と が may で あ っ た. Except the last に, DEG analytic か ら し た 16 patients with SD を additional し た total 49 cases の バ リ デ ー シ ョ ン コ ホ ー ト で, 14 but 伝 セ ッ ト の パ フ ォ ー マ ン ス を review 価 し た result type, class ク ラ ス タ リ ン グ よ り も statistics of fast high が い コ ン セ ン サ ス ク ラ ス タ リ ン グ に て, unseen が 95.8% Vs. 48.0% と 顕 the に different な る ク ラ ス タ ー form が reproducibility を も っ て may で あ る こ と を Ming ら か と し た. の above results よ り, immune チ ェ ッ ク ポ イ ン ト resistance against tonic で treatment さ れ た kidney cancer patients の whole blood heritage 伝 son 発 now プ ロ フ ァ イ ル は played sharper sex に よ っ て clear に different な り, immune 応 answer 経 に masato even す る DEG を with い た ク ラ ス タ リ ン グ に よ り play working group of を に correct classification で き る こ と が Ming ら か と な っ た.

项目成果

転移性腎癌における全血遺伝子発現は免疫チェックポイント阻害剤の治療効果を予測する

转移性肾癌的全血基因表达预测免疫检查点抑制剂的治疗效果

• 发表时间: 2022
• 作者: 南雲義之;小島崇宏 他
• 通讯作者: 小島崇宏 他

Whole-Blood Gene Expression Profiles Correlate with Response to Immune Checkpoint Inhibitors in Patients with Metastatic Renal Cell Carcinoma.

• DOI: 10.3390/cancers14246207
• 发表时间: 2022-12-15
• 期刊: CANCERS
• 影响因子: 5.2
• 作者: Nagumo, Yoshiyuki;Kandori, Shuya;Kojima, Takahiro;Hamada, Kazuki;Nitta, Satoshi;Chihara, Ichiro;Shiga, Masanobu;Negoro, Hiromitsu;Mathis, Bryan J.;Nishiyama, Hiroyuki
• 通讯作者: Nishiyama, Hiroyuki