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ゲノムワイド関連解析に基づくメニエール病の原因遺伝子探索

ゲノムワイド関連解析に基づくメニエール病の原因遺伝子探索
基于全基因组关联分析寻找梅尼埃病致病基因
批准号：
21K09560
负责人：
伊賀 朋子
金额：
$2.66万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K09560/
关键词：
内耳造影MRIGWASメニエール病の原因遺伝子メニエール病自宅眼振記録装置ゲノム解析

项目摘要

项目成果

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取得した血液検体より、ASAチップによるタイピングデータを取得。バイオバンクジャパンの公開データをコントロールとしてゲノムワイド関連解析を実施した。データQCとしての特記事項としては、MHC関連疾患群をコントロールサンプルから除外することと、日本国内における本土クラスタと琉球クラスタを区別し、後者を全サンプルから除外することとした。その結果、ケース群として197サンプル、コントロール群として43,859サンプルを得た。ゲノムワイド有意水準を満たす一塩基多型も得られたが、集団内のアレル頻度やimputation時のR2値より不適切であると判断。現在は、上位の一塩基多型に関するe-QTLの関連や、検体の追加を考慮している。
英文摘要
取得した血液検体より、ASAチップによるタイピングデータを取得。バイオバンクジャパンの公開データをコントロールとしてゲノムワイド関連解析を実施した。データQCとしての特記事項としては、MHC関連疾患群をコントロールサンプルから除外することと、日本国内における本土クラスタと琉球クラスタを区別し、後者を全サンプルから除外することとした。その結果、ケース群として197サンプル、コントロール群として43,859サンプルを得た。ゲノムワイド有意水準を満たす一塩基多型も得られたが、集団内のアレル頻度やimputation時のR2値より不適切であると判断。現在は、上位の一塩基多型に関するe-QTLの関連や、検体の追加を考慮している。
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精准表型鉴定联合pan-GWAS发掘谷子萌发期抗旱性的关键候选基因及优异等位变异
  • 批准号：
    32500337
  • 项目类别：
    青年科学基金项目（C类）
  • 资助金额：
    30.00万元
  • 批准年份：
    2025
  • 负责人：
    杨阳
  • 依托单位：
    山西农业大学
整合GWAS与单细胞多组学解析克罗恩病纤维化中肠道菌群-宿主互作机制研究
  • 批准号：
  • 项目类别：
    省市级项目
  • 资助金额：
    --
  • 批准年份：
    2025
  • 负责人：
    魏艳玲
  • 依托单位：
    陆军军医大学
基于多表型GWAS的广西壮族肌少—骨质疏松症遗传解析及应用研究
  • 批准号：
    82560288
  • 项目类别：
    地区科学基金项目
  • 资助金额：
    32.00万元
  • 批准年份：
    2025
  • 负责人：
    宾晓芸
  • 依托单位：
    右江民族医学院
基于全基因组关联分析（GWAS） 的林麝麝香质量相关基因挖掘
  • 批准号：
  • 项目类别：
    省市级项目
  • 资助金额：
    --
  • 批准年份：
    2025
  • 负责人：
    郑瑶
  • 依托单位：
    重庆市药物种植研究所