Radiogenomics analysis of tongue cancer using PET / MRI and nCounter

使用 PET / MRI 和 nCounter 对舌癌进行放射基因组学分析

• 批准号: 21K09579
• 负责人: 菅野 真史
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: University of Fukui
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K09579/
• 关键词: PET/MRI; Radiogenomics; nCounter; nCounter解析; 患者集積完了; RNA抽出; RNA品質チェック完了

カンファレンスを行い研究の進捗および方針について確認した。患者選定が終了し舌癌組織標本(FFPEブロック)からRNeasy FFPE Kit(Qiagen)を用いてRNA抽出を行い、さらに品質チェックを行い遺伝子解析可能であることを確認した。RNA抽出が終了した。nCounter解析の準備が完了した。遺伝子解析に必要な物品を前倒し至急で予算を整え購入し納入された。筑波大学でのｎCounter解析待ちの状態。造影CT、造影MRI、PET/MRI、PET/CT検査の読影および画像データの抽出を行った。PET/MRIの画像情報として、腫瘍最大径、DOI、腫瘍形態、SUV、エナジー、コントラスト、エントロピー、ヒートマップ、インテンシティー、腫瘍辺縁部の明瞭度・不明瞭度、Normalized Mutual Informationアルゴリズムを用いた線形変換による比較、腫瘍形態の３次元化など２０項目以上の特徴量を抽出した。病理医専門医（今村）が、組織標本における組織診断ならびにT分類、DOI、浸潤様式、脈管及び神経周囲浸潤の診断を行った。論文化作業を行っている。

カンファレンスを行い Research の捗および Policy についてConfirmation した. The patient selected the final tongue cancer tissue specimen (FFPE) and RNeasy FFPE Kit (Qiagen) uses RNA extraction and analysis, and can confirm the quality of the RNA. RNA extraction is complete. The preparation for nCounter analysis is complete. The analysis of the remaining items is that the necessary items must be put forward and urgent, and the items must be purchased and included in the order. University of Tsukuba's Counter analyzes the waiting status. Contrast CT, contrast MRI, PET/MRI, PET/CT 検看の読影およびimage データのdraw を行った. PET/MRI imaging information, tumor maximum diameter, DOI, tumor shape, SUV, エナジー, コントラスト,エントロピー, ヒートマップ, インテンシティー, swelling and swelling of the 踁bu's clear degree, unclear degree, Normalized Mutual Information has used the linear transformation to compare the による and the 3-dimensional transformation of the tumor into 20 or more items. Pathology specialist (Imamura), tissue specimen diagnosis, tissue diagnosis, classification, DOI, infiltration type, vasculature, and diagnosis of peripheral invasion. On cultural homework を行っている.