The elucidation of carcinogenesis, metastasis gene and development of non-invasive treatment of sebaceous gland carcinoma with the next-generation sequencer

本研究は、1:次世代シーケンサーを用いた脂腺癌の網羅的遺伝子解析、2:臨床病型との照合、人種差の原因解明、3:発癌、増殖及び転移に関わる細胞内伝達機構を明らかにし、予後推測および内科的治療法につなげることが目的である。我々は、昨年度に眼瞼の瞼板組織より安定かつ簡便なRNA、DNAの核酸抽出方法の確立と比較検討作業を行ってきた。その結果、組織の破砕には凍結破砕器を、精製方法にはカラム法を用いることにより、他の破砕、抽出方法よりも短時間かつ安定的に核酸抽出が可能であった。本年度は、その方法を用いて、脂腺癌9症例から各々正常及び癌組織のRNA、DNAの抽出を行ない、次世代シークエンスが可能な品質のRNA、DNAを獲得した。さらに抽出したRNAに関してトランスクリプトーム解析を施行し、データを取得した。今後、抽出したDNAからエキソームデータの解析を行う予定である。我々はすでにヒト眼瞼脂腺癌の腫瘍組織とその健側の同部位の瞼板組織6症例分の次世代シーケンサーの実験結果を入手しており、DNAに対しては全エクソーム解析、RNAに対してはトランスクリプトーム解析データを入手している。本年度施行した９症例のうち3症例がアジア人には少ない脂腺癌のタイプであるdiffuseタイプである。すでに入手している6症例の遺伝子解析結果と、今回の９検体の遺伝子解析の結果を合わせて解析を行い、関連するpathwayの絞り込み、脂腺癌特異的な遺伝子の発現や変異をRNA、DNAレベルで検討できると考えている。

本研究は、1:次世代シーケンサーを用いた脂腺癌の網羅的遺伝子解析、2:臨床病型との照合、人種差の原因解明、3:発癌、増殖及び転移に関わる細胞内伝達機構を明らかにし、予後推測および内科的治療法につなげることが目的である。我々は、昨年度に眼瞼の瞼板組織より安定かつ簡便なRNA、DNAの核酸抽出方法の確立と比較検討作業を行ってきた。その結果、組織の破砕には凍結破砕器を、精製方法にはカラム法を用いることにより、他の破砕、抽出方法よりも短時間かつ安定的に核酸抽出が可能であった。本年度は、その方法を用いて、脂腺癌9症例から各々正常及び癌組織のRNA、DNAの抽出を行ない、次世代シークエンスが可能な品質のRNA、DNAを獲得した。さらに抽出したRNAに関してトランスクリプトーム解析を施行し、データを取得した。今後、抽出したDNAからエキソームデータの解析を行う予定である。我々はすでにヒト眼瞼脂腺癌の腫瘍組織とその健側の同部位の瞼板組織6症例分の次世代シーケンサーの実験結果を入手しており、DNAに対しては全エクソーム解析、RNAに対してはトランスクリプトーム解析データを入手している。本年度施行した９症例のうち3症例がアジア人には少ない脂腺癌のタイプであるdiffuseタイプである。すでに入手している6症例の遺伝子解析結果と、今回の９検体の遺伝子解析の結果を合わせて解析を行い、関連するpathwayの絞り込み、脂腺癌特異的な遺伝子の発現や変異をRNA、DNAレベルで検討できると考えている。