The elucidation of carcinogenesis, metastasis gene and development of non-invasive treatment of sebaceous gland carcinoma with the next-generation sequencer

阐明皮脂腺癌的癌变、转移基因及新一代测序仪无创治疗的进展

• 批准号: 21K09726
• 负责人: 渡辺 彰英
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Kyoto Prefectural University of Medicine
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K09726/
• 关键词: 脂腺癌; 瞼板; dissuse type; エクソーム解析; トランスクリプトーム解析; 核酸抽出法; 腫瘍組織; 次世代シーケンサー; 遺伝子解析; 発癌・転移遺伝子; 非観血的治療

本研究は、1:次世代シーケンサーを用いた脂腺癌の網羅的遺伝子解析、2:臨床病型との照合、人種差の原因解明、3:発癌、増殖及び転移に関わる細胞内伝達機構を明らかにし、予後推測および内科的治療法につなげることが目的である。我々は、昨年度に眼瞼の瞼板組織より安定かつ簡便なRNA、DNAの核酸抽出方法の確立と比較検討作業を行ってきた。その結果、組織の破砕には凍結破砕器を、精製方法にはカラム法を用いることにより、他の破砕、抽出方法よりも短時間かつ安定的に核酸抽出が可能であった。本年度は、その方法を用いて、脂腺癌9症例から各々正常及び癌組織のRNA、DNAの抽出を行ない、次世代シークエンスが可能な品質のRNA、DNAを獲得した。さらに抽出したRNAに関してトランスクリプトーム解析を施行し、データを取得した。今後、抽出したDNAからエキソームデータの解析を行う予定である。我々はすでにヒト眼瞼脂腺癌の腫瘍組織とその健側の同部位の瞼板組織6症例分の次世代シーケンサーの実験結果を入手しており、DNAに対しては全エクソーム解析、RNAに対してはトランスクリプトーム解析データを入手している。本年度施行した９症例のうち3症例がアジア人には少ない脂腺癌のタイプであるdiffuseタイプである。すでに入手している6症例の遺伝子解析結果と、今回の９検体の遺伝子解析の結果を合わせて解析を行い、関連するpathwayの絞り込み、脂腺癌特異的な遺伝子の発現や変異をRNA、DNAレベルで検討できると考えている。

This study includes: 1. genetic analysis of the next generation of lipoadenocarcinoma; 2. identification of clinical patterns and ethnic differences; 3. identification of intracellular mechanisms related to cancer development, proliferation and migration; and 3. future speculation of medical treatment. We conducted a comparative study on the establishment of simple RNA and DNA extraction methods for eyelid tarsus tissue stability last year. The results, tissue breakdown, freezing breakdown, purification methods, extraction methods, short-term stability, nucleic acid extraction are possible. This year, the method was used to extract RNA and DNA from 9 cases of lipoadenocarcinoma, including normal and cancerous tissues, and to obtain RNA and DNA of different quality in the next generation. To extract the RNA from the database, we need to analyze the database. From now on, extract DNA from the database and analyze it in a predetermined way. We started with the results of 6 cases of eyelid lipoadenocarcinoma and 6 cases of meibomian tissue from the same site on the healthy side. We started with the complete analysis of DNA and RNA. This year, 9 cases of cancer were diagnosed and 3 cases were diagnosed. The results of gene analysis of 6 cases were analyzed, and the results of gene analysis of 9 cases were combined to analyze the relationship between pathway and gene expression of adenocarcinoma specific gene, RNA and DNA.

项目成果

眼瞼脂腺癌の局所再発と転移に関与する因子の検討

眼睑皮脂腺癌局部复发转移相关因素的探讨

• 发表时间: 2021
• 作者: 奥拓明;渡辺彰英;中山知倫;大山泰司;外園千恵
• 通讯作者: 外園千恵

涙点を含む眼瞼腫瘍症例の検討

累及泪点的眼睑肿瘤病例的检查

• 发表时间: 2021
• 作者: 大内亜由美;Kevin Eade;Sarah Giles;Martin Friedlander;海老原伸行;奥拓明，渡辺彰英，中山知倫，大山泰司，外園千恵
• 通讯作者: 奥拓明，渡辺彰英，中山知倫，大山泰司，外園千恵

眼瞼悪性腫瘍に対するTenzel flapとHughes flap.

Tenzel 皮瓣和 Hughes 皮瓣用于治疗恶性眼睑肿瘤。

• 发表时间: 2022
• 期刊: Monthly Book OCULISTA
• 作者: Sakaue S;Hosomichi K;Hirata J;Nakaoka H;Yamazaki K;Yawata M;Yawata N;Naito T;Umeno J;Kawaguchi T;Matsui T;Motoya S;Suzuki Y;Inoko H;Tajima A;Morisaki T;Matsuda K;Kamatani Y;Yamamoto K;Inoue I;Okada Y;渡辺彰英
• 通讯作者: 渡辺彰英

ヒト眼瞼脂腺癌組織からの核酸の抽出方法の検討

人眼睑皮脂腺癌组织核酸提取方法的研究

• 发表时间: 2022
• 作者: Otsuka Yuki;Oishi Akio;Miyata Manabu;Uji Akihito;Oishi Maho;Hasegawa Tomoko;Numa Shogo;Ikeda Hanako Ohashi;Tsujikawa Akitaka;奥拓明，渡辺彰英，米田亜規子，中山知倫，徳田雄市，中野正和，田代啓，外園千恵
• 通讯作者: 奥拓明，渡辺彰英，米田亜規子，中山知倫，徳田雄市，中野正和，田代啓，外園千恵

Efficient DNA/RNA extraction from tarsal plates by SK mill, a freeze-crush apparatus

使用冷冻粉碎设备 SK mill 从跗骨板中高效提取 DNA/RNA

• DOI: 10.1093/jb/mvac078
• 发表时间: 2022
• 期刊: The Journal of Biochemistry
• 作者: Oku Hiroaki;Watanabe Akihide;Tokuda Yuichi;Nakayama Tomomichi;Tashiro Kei;Sotozono Chie;Nakano Masakazu
• 通讯作者: Nakano Masakazu