増加している口腔癌を含むHPV関連疾患の予防に向けた感染HPVの型と細菌叢の解析

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本研究では、これまでにベトナム、モンゴルにて採取した1,800名以上の口腔粘膜試料のうち、HPV陽性試料について、16S rRNA PCR産物をもとに細菌叢解析を行い、約40種の粘膜指向性HPVの型と細菌叢の関連を検討し、年々増加している口腔癌を含むHPV関連疾患の予防に向けた基礎データを得ることを目的としている。当講座にて、これまでに採取した口腔粘膜擦過試料より、HPV感染の有無と感染HPVの型の検出を行っている。潜伏感染中の少量のウイルスも検出し得ると思われる感度の高い検出法として、ある程度断片化された鋳型DNAからも検出し得るPCR産物の小さな改良コンセンサスプライマー（MGP）セットを用いたPCRと、約40種類にのぼる粘膜指向性HPV型特異的プローブを用いたReverse Line Blot法を組み合せる方法により、HPV感染の検出と感染HPVの型の同定を行っている。また、検体採取の際に収集した疫学データ（喫煙、飲酒、口腔粘膜疾患の有無と種類、口腔内補綴修復物の有無など）を整理し、本研究のデータベースへの登録を行っている。2021、2022年度は、当初の計画より大幅に遅れた。16S rRNA PCR産物をもとにした細菌叢解析（16S rRNA領域特異的ライブラリーの作成、16S rRNA PCR産物の解析、16S rRNAデータベースに対する相同性検索および系統分類解析）には至らなかった。在庫の試薬等を使用したため、本研究費からの支出はなかった。