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埼玉県内の臨床および下水から分離したESBL産生大腸菌の解析

埼玉县临床及污水源产ESBL大肠杆菌分析

基本信息

批准号：
21K10418
负责人：
岸井こずゑ
金额：
$ 1.66万
依托单位：
Saitama Prefectural University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

本研究は、埼玉県内の環境及び臨床由来ESBL産生Escherichia coliを対象として薬剤感受性試験、耐性遺伝子解析および全ゲノム解析を行い、各分野の薬剤耐性の状況や相互の関係性を明らかにすることを目的とする。本年度は、埼玉県内の下水処理場流入水（2020年10, 12月, 2021年2, 4, 6, 8月採水）より分離したESBL産生E. coli 30株および当該下水処理場の流域下水道処理区域内の病院から同時期に分離された臨床由来ESBL産生 E. coli 55株の詳細なCTX-M遺伝子型を決定し、さらにMLSTによる菌株の系統解析を進めた。CTX-M遺伝子型については、臨床由来株ではCTX-M-27（44.4%）が最も多かったが、下水由来株ではCTX-M-15（30.0%）やCTX-M-14（23.3%）がCTX-M-27（20.0%）よりも多く検出された。MLST型については、臨床由来株のSTはST131が81.5%を占め、圧倒的に高い割合となった。ST131に次いで多く見られたSTは、近年徐々に増加傾向を示すハイリスククローンとして報告されているST1193（5.6%）であった。一方、下水由来株のSTにおいては、ST131（26.7%）が最多、次いでST1193（16.7%）が多く見られたが、臨床由来株に比べてST1193の占める割合が高い結果となり、他にも非常に多種類のSTが検出された。いくつかのSTがCCとしてまとめられたが、独立性の高いSTが多く、臨床由来株に比べてバリエーションに富んでいた。起源が多様なため、臨床では見られていないクローンも含め網羅的に検出された可能性が示唆される。今後は、下水および臨床から分離されたESBL産生E. coliの中から各STの代表株を選び、既に全ゲノム配列が決定している基準株を含めた比較ゲノム解析を進めていく。

This study aims to clarify the environmental and clinical origin of ESBL in Saitama Prefecture, susceptibility test, resistance gene analysis, and overall resistance analysis, as well as the relationship between each field and each other. This year, the inflow water from the sewage treatment plant in Saitama (October, December 2020, February, April, June, August 2021) was separated and ESBL produced E. E. coli 30 strains were isolated at the same time from the sewage treatment plant in the drainage area of the hospital. coli strain 55. The detailed CTX-M genotype was determined and the phylogenetic analysis of MLST strains was carried out. CTX-M gene type was most frequently detected in CTX-M-27 (44.4%), CTX-M-15 (30.0%), CTX-M-14 (23.3%), CTX-M-27 (20.0%), CTX-M-27 (44.4%), CTX-M-15 (30.0%) and CTX-M-14 (23.3%). MLST type, clinical origin of ST ST131, high pressure of ST1193 (5.6%) was reported to have increased in recent years. One side, the water origin of ST, ST131 (26.7%), the second middle of ST1193 (16.7%), the most common, clinical origin of ST1193, the most common, the most common, the most common. In the middle of the day, the ST is more independent than the ST, and the clinical origin is more rich than the ST The origin of the disease is multiple, and the clinical symptoms are different. In the future, E. coli, the representative strains of each ST were selected, and all the strains were arranged and determined. The reference strains were analyzed and compared.