2型糖尿病の遺伝的スコアと合併症、癌、がんゲノムとの関係

2 型糖尿病遗传评分与并发症、癌症和癌症基因组之间的关系

• 批准号: 21K10489
• 负责人: 北島 秀俊
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2022-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K10489/
• 关键词: 糖尿病; 2型糖尿病; がん

糖尿病は、網膜症、腎症、神経障害、冠動脈疾患、および脳血管障害などの合併症のリスクが増加するばかりではなく、癌のリスクも増加することが報告されている。また、近年のGWAS (Genome Wide Association Study)の躍進にともない、2型糖尿病や血糖関連値では少数の強い効果を持つ遺伝子の変異ではなく、各々の遺伝的な影響が小さい数百個以上の多数のSNPにより遺伝要因が形成されていることが明らかになってきた。本研究は、観察研究にて欧米人に比べ糖尿病症例の癌罹患リスクが高いと報告されている東アジア人において、2型糖尿病、ならびに血糖関連値の遺伝的スコアと合併症や癌との関係をPolygenic risk score解析やメンデル無作為化（MR）解析を用いて検討することを目的とした。当初は、東アジア人の2型糖尿病のメタGWAS（Spracklenら、Nature, 2020）で全ゲノムレベルの優位な相関が報告された遺伝子領域のlead SNVを操作変数とし、その要約統計量を暴露項目とすることとしていたが、非糖尿病検体の血糖関連値を対象としたメタGWAS（Chenら、Nat Genet, 2021）も報告されたため、それらのlead SNVと要約統計量も使用することとした。今年度は、解析環境を整備しつつ、アウトカムの要約統計量として、東アジア人の合併症、癌、リスク因子のGWASの公開要約統計量を利用するtwo-sample MR法に取り組んだ。まず、inverse variance weightedモデルを用い、sensitive analysisとして、weighted medianモデル、mode-basedモデルなどを検討しているところである。

は diabetes, retinal disease, kidney disease, god 経 handicap, coronary artery disease, お よ び 脳 vascular handicap of な ど の complications の リ ス ク が raised plus す る ば か り で は な く, cancer の リ ス ク も raised plus す る こ と が report さ れ て い る. Youdaoplaceholder0, recent また GWAS (Genome Wide Association Study の leap に と も な い や, type 2 diabetes blood sugar masato even numerical で は strong minority の い unseen fruit を hold つ heritage 伝 son の - different で は な く, various 々 の but 伝 な が small effect さ い hundreds more の most の SNP に よ り heritage 伝 by が form さ れ て い る こ と が Ming ら か に な っ て き た. This study は and examines 観 に て omega man に than べ cases diabetics リ の cancer ス ク が high い と report さ れ て い る east ア ジ ア people に お い て, type 2 diabetes, な ら び に masato blood sugar on the numerical の but 伝 ス コ ア と complications や carcinoma と の masato is を Polygenic risk score analysis: やメ デ デ やメ inaction (MR) analysis: を using やメ て検 to seek する とを とを objective: と た. Youdaoplaceholder7, dong アジア people <s:1> type 2 diabetes <s:1> メタGWAS (Spracklenら, Nature) 2020) で full ゲ ノ ム レ ベ ル の optimal bit phase な masato が report さ れ た heritage 伝 sub-fields の lead SNV を operation - several と し, そ の を exposed project offer statistics と す る こ と と し て い た が masato, non-diabetic 検 の blood sugar on the numerical を like と seaborne し た メ タ GWAS (Chen ら, Nat Genet, 2021) それら report されたため, それら <s:1> lead SNVと offer statistics <e:1> use する とと とと た. Gearing up our は, analytic environment を し つ つ, ア ウ ト カ ム の offer statistics と し て, east ア ジ ア の complications, cancer, リ ス ク factor の GWAS の を publicly offer statistics using す る two group - the sample MR take り に ん だ. ま ず, inverse variance weighted モ デ ル を い, sensitive analysis と し て, weighted median モ デ ル, mode - -based モ デ ル な ど を beg し 検 て い る と こ ろ で あ る.