Does the intestinal flora affect glucose tolerance? -Comparative study of high HbA1c and normal areas
肠道菌群会影响糖耐量吗?
基本信息
- 批准号:21K11011
- 负责人:
- 金额:$ 2.66万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
2021年度に千葉県銚子市で収集した糞便検体について腸内細菌叢の分析を行った。各検体から10,000 read の16S rRNAのアンプリコンをアノテーションし全体で10門、192属、488種の細菌を同定し構成比を得た。検体内の菌の多様性を示すα-多様性(Speciesレベル)は、Observed, Chao1, ACE, Fisher のいずれの指標もHbA1c高値群(5.6%以上; H群)の方が正常群(5.5%以下; N群)より有意に小さかった。また、検体間の菌叢距離を示すβ-多様性(Speciesレベル)はBray-Cutis index,Jensen-Shannon Divergence, Jaccard index のいずれの指標でもH群とN群の間には有意な違いがあった。Genusレベルで比較すると、N群の方がH群よりも有意に多い菌はGordonibacter, Catenibacillus などの15属、有意に少ない菌はFusobacterium, Bacteroides などの4属であった。Speciesレベルで比較すると、N群の方がH群よりも有意に多い菌はAlistipes_putredinis, Anaerostipes_hadrus などの31種、有意に少ない菌はLachnospiraceae_bacterium_9_1_43BFAA9, Catenibacillus_scindens などの9種であった。また、腸内細菌叢(Species)を説明変数としてH群とN群を分類するよう ortho PLS-DAを行ったところ、N群とH群を綺麗に分類することができた。このとき VIP score の上位5菌種は、大きい方からGordonibacter_pamelaeae (N群 > H群)、Bacteroides_sp__Smarlab_3302398(N群 > H群)、Ruminococcus_sp__14531(N群 > H群)、Lachnospiraceae_bacterium_8_1_57FAA(N群 > H群)、Lachnospiraceae_bacterium_9_1_43BFAA(N群 < H群)であった。
我们分析了2021年在Choshi City收集的Choshi City的粪便标本上的肠道菌群。每个标本都以16S rRNA扩增子的10,000个读数注释,总共鉴定了488种细菌,并获得了组成比。在HBA1C高组中,表明样品内细菌多样性的α多样性(物种水平)(5.6%或更多; H组)明显小于正常组(5.5%或更少; N组)。此外,对于Bray-Cutis指数,Jensen-Shannon Divergence和Jaccard指数的所有指标,H组和N组之间存在显着差异。当在属水平上进行比较时,N组中的15属属比在H组中比较普遍,例如Gordonibacter和Catenibacillus,N组中的4个属的普遍性明显更为普遍,而哥替型和菌杆菌和细菌剂则更少。 When comparing at the Species level, 31 species in group N were significantly more common than in group H, such as Alistipes_putredinis and Anaerostipes_hadrus, and 9 species in group N were significantly less common, such as Lachnospiraceae_bacterium_9_1_43BFAA9 and Catenibacillus_scindens.此外,当对Ortho PLS-DA进行了将H和N组与肠菌群(物种)分类为解释性变量时,N组和H组能够整齐地进行分类。目前,VIP分数的前五种是Gordonibacter_pamelaeae(组H组H组),Bacteroides_sp__smarlab_3302398(N>组H组),Ruminococcus_sp_sssp__14531(组N>组N>组N>组N>组N>组N>组) lachnospiraceae_bacterium_9_1_43bfaa(n <组H组)。
项目成果
期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
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