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Does the intestinal flora affect glucose tolerance? -Comparative study of high HbA1c and normal areas

肠道菌群会影响糖耐量吗？

基本信息

批准号：
21K11011
负责人：
鈴木良雄
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Juntendo University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

2021年度に千葉県銚子市で収集した糞便検体について腸内細菌叢の分析を行った。各検体から10,000 read の16S rRNAのアンプリコンをアノテーションし全体で10門、192属、488種の細菌を同定し構成比を得た。検体内の菌の多様性を示すα-多様性（Speciesレベル）は、Observed, Chao1, ACE, Fisher のいずれの指標もHbA1c高値群（5.6%以上; H群）の方が正常群（5.5%以下; N群）より有意に小さかった。また、検体間の菌叢距離を示すβ-多様性（Speciesレベル）はBray-Cutis index,Jensen-Shannon Divergence, Jaccard index のいずれの指標でもH群とN群の間には有意な違いがあった。Genusレベルで比較すると、N群の方がH群よりも有意に多い菌はGordonibacter, Catenibacillus などの15属、有意に少ない菌はFusobacterium, Bacteroides などの4属であった。Speciesレベルで比較すると、N群の方がH群よりも有意に多い菌はAlistipes_putredinis, Anaerostipes_hadrus などの31種、有意に少ない菌はLachnospiraceae_bacterium_9_1_43BFAA9, Catenibacillus_scindens などの9種であった。また、腸内細菌叢（Species）を説明変数としてH群とN群を分類するよう ortho PLS-DAを行ったところ、N群とH群を綺麗に分類することができた。このとき VIP score の上位5菌種は、大きい方からGordonibacter_pamelaeae (N群 > H群)、Bacteroides_sp__Smarlab_3302398(N群 > H群)、Ruminococcus_sp__14531(N群 > H群)、Lachnospiraceae_bacterium_8_1_57FAA(N群 > H群)、Lachnospiraceae_bacterium_9_1_43BFAA(N群 < H群)であった。

In 2021, the collection of feces in Choko City, Chiba Prefecture, and the analysis of intestinal bacterial flora were carried out. Each body has 10,000 reads and the 16S rRNA のアンプリコンをアノテーションし has a uniform composition ratio of 10 phyla, 192 genera, and 488 species of bacteria.検The diversity of bacteria in the body indicates the α-diversity (Speciesレベル)は, Observed, Chao1, ACE, Fisher's index, HbA1c high value group (more than 5.6%; H group) and normal group (less than 5.5%; N group) より意に小さかった. Bray-Cutis index, Jensen-Shannon Divergence, Jaccard indexのいずれのINDICATOR でもH group とN group の间には intentional なviolation いがあった. Genus レベルで compare すると, N group の方がH group よりも intentionally many い bacteria は Gordonibacter, Catenibacillus などの 15 genus, intentional ににない bacteria は Fusobacterium, Bacteroidesなどの4 belongs to であった. Species レベルで compare すると、N group の方がH group よりも intentionally に多い germ はAlistipes_putredinis, Anaerostipes_hadrus Lachnospiraceae_bacterium_9_1_43BFAA9, Catenibacillus_scindens 9 species.また、Intestinal bacterial flora (Species) をExplanation value としてH group とN group をClassification するよう ortho PLS-DA を行ったところ, N group and H group を绮丽に classifying することができた.このとき VIP score の上5 strainsは、大きい方からGordonibacter_pamelaeae (N group > H group), Bacteroides_sp__Smarlab_3302398 (N group > H group), Ruminococcus_sp__14531 (N group > H group), Lachnospiraceae_bacterium_8_1_57FAA (N group > H group), Lachnospiraceae_bacterium_9_1_43BFAA (N group < H group)であった.