Elucidation of splicing-code with RNA-specialized machine learning system toward overcoming hereditary diseases having splicing misregulations

利用RNA专用机器学习系统阐明剪接代码，以克服剪接失调的遗传性疾病

• 批准号: 20K07310
• 负责人: IIDA Kei
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Kindai University (2022)Kyoto University (2020-2021)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K07310/
• 关键词: RNAスプライシング; 人工知能; ケミカルバイオロジー; 遺伝性疾患; バイオインフォマティクス; 機械学習

项目成果

In silico strategy for the identification of deep-intronic variants causing aberrant splicing

用于识别导致异常剪接的深内含子变异的计算机策略

• 发表时间: 2022
• 作者: 黒澤凌;網代将彦;飯田慶;粟屋智就;山田茉未子;小崎健次郎;萩原正敏
• 通讯作者: 萩原正敏

RNA結合タンパク質の標的分子探索手法を開発 －複雑なRNA制御のメカニズム解明に期待－

开发寻找RNA结合蛋白靶分子的方法 - 有望阐明RNA调控的复杂机制 -

RNAスプライシング制御による新規がん免疫療法―ネオ抗原を産生増強する治療薬候補の同定―

通过调节RNA剪接的新型癌症免疫疗法 - 鉴定增强新抗原产生的候选治疗药物 -

Chemical induction of splice-neoantigens attenuates tumor growth in a preclinical model of colorectal cancer

• DOI: 10.1126/scitranslmed.abn6056
• 发表时间: 2022-11
• 期刊: Science Translational Medicine
• 影响因子: 17.1
• 作者: Shingo Matsushima;M. Ajiro;K. Iida;K. Chamoto;T. Honjo;M. Hagiwara

多層バイオインフォマティクス分析による、機能指向的な SFPQ の標的特異性と認識機構の解明

通过多层生物信息学分析阐明功能导向SFPQ的靶标特异性和识别机制

• 发表时间: 2020
• 作者: 飯田慶;武内章英;萩原正敏
• 通讯作者: 萩原正敏