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ながはまコホートおよび佐渡コホートのゲノム情報解析による、尿酸値関連変異の探索

ながはまコホートおよび佐渡コホートのゲノム情報解析による、尿酸値関連変異の探索
通过长滨和佐渡队列的基因组信息分析寻找与尿酸水平相关的突变
批准号:
20K07316
负责人:
三澤 計治
金额:
$2.75万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-01 至 2024-03-31

项目摘要

项目成果

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本申請課題は、個人が生まれながらに持つ遺伝的な要因と、個人が生活している環境の要因の相互作用を解明し、より効果的な治療法の開発に貢献することを目標としている。そのため、統計的な手法やバイオインフォマティクスの手法を用いて解析する手法の改良を行なっている。尿酸トランスポーターURAT1は、腎臓で尿酸の再吸収を担当しており、ヒトの尿酸値に重要な影響を与えている。尿酸値に対する遺伝的要因を定量的に評価するためには、URAT1に及ぼす変異の影響を正確に推定しなければならない。URAT1タンパク質の尿酸取り込み量の測定は、アフリカツメガエル(Xenopus laevis)の卵母細胞を用いて行われる。アフリカツメガエルのゲノム中にはSLC22A12遺伝子が見つかっていない。この研究では、尿酸取り込み量の正確な測定のために、SLC22A12遺伝子がアフリカツメガエルに存在しないことを確認した。まず、さまざまな生物種から取得したSLC遺伝子族の配列に対し、SLC22A12遺伝子のホモロジーサーチを行った。その結果、SLC22A12遺伝子は、起源の異なる複数の遺伝子の遺伝子フュージョンにより生じたことが示唆された。遺伝子フュージョンとは、複数の遺伝子が融合して新しい遺伝子が生まれ、新たな機能を持つタンパク質が生じる現象である。SLC22A12遺伝子がアフリカツメガエルで見られない理由は、哺乳類と両生類の祖先が分岐した時点では、まだSLC22A12遺伝子を生み出す遺伝子フュージョンが起こっていなかったためと推定される。この成果から、アフリカツメガエルを用いた尿酸取り込み能力の推定は正確であることが予想される。この研究成果は現在、投稿準備中である。
期刊论文(9)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
論文執筆のための人工知能ツール
用于撰写论文的人工智能工具
DOI: --
发表时间: 2023
期刊:
影响因子: --
作者: [Funato Yosuke, Miki Hiroaki, 三澤計治]
通讯作者: 三澤計治
尿酸トランスポーターSLC22A12遺伝子は、複数の祖先遺伝子のキメラとして誕生した
尿酸转运蛋白SLC22A12基因作为多个祖先基因的嵌合体而诞生。
DOI: --
发表时间: 2023
期刊:
影响因子: --
作者: [Namekata Iyuki, Ryosuke Odaka, Shogo Hamaguchi, Hikaru Tanaka, 三澤計治]
通讯作者: 三澤計治
カーネル統計量の計算のための簡便な方法Genotype Value Decompositionの開発
开发基因型值分解,一种计算核统计的简单方法
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [三澤計治]
通讯作者: 三澤計治
進化的距離から主成分分析(PCA)を行う
从进化距离执行主成分分析 (PCA)
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [Funato Yosuke, Yamazaki Daisuke, Okuzaki Daisuke, Yamamoto Nobuhiko, Miki Hiroaki, 三澤計治]
通讯作者: 三澤計治
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