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The analysis of microbiota for intestinal colonization of ESBL-producing bacteria

产 ESBL 细菌肠道定植的微生物群分析

基本信息

批准号：
20K08843
负责人：
柳原克紀
金额：
$ 2.75万
依托单位：
Nagasaki University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

ESBL産生菌の代表的な菌種である肺炎桿菌の病態を解析するために分子疫学的解析を実施した。本研究では血液培養から分離された肺炎桿菌を対象にした。高病原性肺炎桿菌（hypervirulent Klebsiella pneumoniae, hvKp）のマーカーであるrmpAの検出や莢膜血清型の決定、MLSTによる菌のタイピングを行った。対象となった268株のうちrmpA陽性株は36株（13.4%）であった。rmpA陽性株では陰性株と比較して、他の病原因子の保有率や、血清型K1、K2である割合が有意に高い結果となった。MLSTではrmpA陽性36株のうちST23/K1が最も多く、次いでST86/K2であった。一方、ST412、ST268を多く認めた。臨床像ではrmpA陽性群において肝膿瘍を生じた症例が22.2％（陰性群7.4%）と有意に多く、抗癌剤の投与歴は8.3％（陰性群26.9%)と有意に少なく、侵入門戸が胆道系感染症である割合は8.3％（陰性群27.8%）と有意に低い結果となった。併存症、既往歴、重症度、死亡率では有意差を認めなかった。肺炎桿菌の分子疫学的特徴および血流感染症の臨床像が明らかになった。マウスの腸内環境を抗菌薬で前処理することで細菌叢が攪乱した“dysbiosis”（腸内細菌叢を構成する細菌種や細菌数が減少することにより、細菌叢の多様性が低下した状態）を誘導し、臨床分離ESBL産生菌を定着させる。抗菌薬を含む選択培地を用いて、腸管内容物を培養し、菌種の同定と定量を行う。Co-housing を行い、定着群と対象群の糞便を採取し、OTU(operational taxonomic unit)などにより構成細菌種の特定や菌種組成の解析を行った。抗菌薬で腸内細菌叢（マイクロバイオーム）のdysbiosisを誘導することは薬剤耐性菌（ESBL-E.coli）の定着に影響することが示された。腸内細菌叢の一部の構成細菌群がESBL-E.coliの定着抵抗性に関与していることが示唆された。これらの結果はマイクロバイオームを活用した耐性菌の定着抑止が有用であることを明らかにした。

The representative strains of ESBL producing bacteria were analyzed by pathological method and molecular epidemiology method. In this study, we isolated Bacillus pneumoniae from blood cultures. Determination of capsular serotypes of hyperpathogenic Klebsiella pneumoniae (hvKp), MLST and bacterial serotypes 36 (13.4%) of 268 plants were positive for RMPA. rmpA positive strains were compared with negative strains, and the retention rate of other pathogenic factors was higher than that of serotype K1 and K2 MLST rmpA positive 36 strains ST23/K1 most, ST86/K2 One side, ST412, ST268. Clinical images showed that 22.2%(7.4%) of patients with rmpA positive group had pustules, 8.3%(26.9%) of patients with rmpA negative group had pustules, 8.3%(27.8%) of patients with rmpA positive group had pustules, 8.3%(26.9%) of patients with rmpA negative group had pustules, 8.3%(27.8%) of patients with rmpA positive group had pustules, 8.3%(26.9%) of patients with rmpA negative group had pustules, 8.3%(27.8%) of patients with rmpA positive group had pustules, 8.3%(27.8%) of patients with rmpA negative group had pustules, and 8.3%(27.8%) of patients with rmpA negative group had pustules. Complications, pasts, severity, mortality, intentional differences The molecular epidemiological characteristics of Bacillus pneumoniae and clinical manifestations of bloodstream infections have been investigated. The bacterial flora is disturbed by pretreatment of the intestinal environment and the diversity of the bacterial flora is reduced. Induction and clinical isolation of ESBL producing bacteria are stable. Antibacterial agents include selection, cultivation, and quantification of intestinal contents. Co-housing, stationary group, collection of feces from the host group, OTU(operational taxonomic unit), analysis of specific species composition constituting bacterial species The induction of dysbiosis in the intestinal bacterial flora of antimicrobial agents and the influence of stable resistance of ESBL-E.coli are shown. A part of the intestinal bacterial flora is composed of ESBL-E.coli, which is closely related to the resistance of the intestinal flora. The result is that the resistant bacteria are stable and useful.