Development of liquid biopsy technology (donor-derived DNA analysis) aimed at improving the results of liver transplantation

开发液体活检技术（供体来源的 DNA 分析），旨在改善肝移植的结果

• 批准号: 20K08967
• 负责人: 篠田 昌宏
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: International University of Health and Welfare
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K08967/
• 关键词: ドナー由来cfDNA; 肝移植; 拒絶反応; グラフト機能; 早期診断; 拒絶; cell free DNA

ctDNA (circulating tumor DNA)に着眼した診断は、「早期診断」「正確性」「低侵襲性」を兼ね備えた新しい技術として注目されている。臓器移植においては、ドナーとレシピエントの遺伝子の違いを利用し、血液中のddcfDNA（donor derived cell free DNA)を検知することによるリキッドバイオプシーの価値が注目されている。心、肺、肝、腎、膵、小腸など各種の臓器移植で移植後急性期におけるグラフト機能マーカーとしての有用性が相次ぎ、複数の臨床試験が行われている。微量なddcfDNAを正確に測定する技術は研究の新規性の一つである。2016年より国立遺伝学研究所によってPCRによる増幅、次世代シーケンシング（Next-generation DNA sequencing、以下NGS）による解析が開始されたが、PCRに用いるprimerによって選択性と増幅効率にbiasがかかるために、PCRによるbiasを避け正確にドナーとレシピエントを区別するためにcapture hybridizationを採用し、生物学的統計を基に1000 Single Nucleotide Polymorphism (SNP)を採用している。またコンピューター解析によってドナーとレシピエントの遺伝情報が無くても解析が可能であり、新規の移植患者のみならず過去に移植を受けた患者にも応用が可能である。SNP多型のパネルは集団毎に異なっており、欧米のパネルを日本人に適用することはできないが、我々は日本人をターゲットとした多型パネルとオリジナルのddcfDNA算出法を確立している。我々は、肝移植後急性期に急性拒絶などで移植肝が障害されていることを把握するのにddcfDNAが有用であるとの仮説を立て研究を行った。

CtDNA (circulating tumor DNA) に eyes し は た diagnosis, early diagnosis, "" "low invasive "を" correctness "and ね prepared え た new し い technology と し て attention さ れ て い る. Viscera transplant に お い て は, ド ナ ー と レ シ ピ エ ン ト の heritage 伝 son の violations い を using し, blood の ddcfDNA (donor derived cell free DNA) を 検 know す る こ と に よ る リ キ ッ ド バ イ オ プ シ ー の 価 numerical が attention さ れ て い る. Heart, lung, liver, kidney, Cui, small intestine な ど various の viscera graft で acute stage after transplantation に お け る グ ラ フ ト function マ ー カ ー と し て の usefulness ぎ が phase time, plural の clinical test line が わ れ て い る. Research on the する technology for the correct に determination of trace なddcfDNAを <s:1> New regulations <e:1> - である である. 2016 よ り national heritage 伝 learning institute に よ っ て PCR に よ る rights, Next generation シ ー ケ ン シ ン グ (Next - generation of DNA Sequencing, the following NGS) に よ る parsing が began さ れ た が, PCR に い る primer に よ っ て sentaku sex と rights of working rate に bias が か か る た め に, PCR に よ る bias, avoid を け right に ド ナ ー と レ シ ピ エ ン ト を difference す る た め に capture hybridizationを employs る, and biological statistical を basis に. 1000 Single Nucleotide Polymorphism (SNP)を employs て て る る. ま た コ ン ピ ュ ー タ ー parsing に よ っ て ド ナ ー と レ シ ピ エ ン ト の heritage 伝 intelligence が no く て も resolution が may で あ り, new rules の transplant の み な ら ず past に transplant を け た patients に も 応 may use が で あ る. SNP polymorphism の パ ネ ル 団 は set their に different な っ て お り, omega is の パ ネ ル を Japanese に applicable す る こ と は で き な い が, I 々 は Japanese を タ ー ゲ ッ ト と し た polymorphism パ ネ ル と オ リ ジ ナ ル の ddcfDNA を calculate a method to establish し て い る. I 々 は, acute phase after lt に acute refused な ど で graft が handicap of さ れ て い る こ と を grasp す る の に ddcfDNA が useful で あ る と の 仮 said を vertical line を っ て research た.

项目成果

移植医療におけるリキッドバイオプシー 肝移植と小腸移植におけるドナー由来cell free DNA解析の試みと展望.

移植医学中的液体活检：肝脏和小肠移植中供体来源的无细胞 DNA 分析的试验和前景。

• 发表时间: 2021
• 作者: 金森 洋樹;山田 洋平;長谷川 康;篠田 昌宏;井ノ上 逸朗;尾原 秀明;北川 雄光;黒田 達夫.
• 通讯作者: 黒田 達夫.

肝移植と小腸移植におけるドナー由来cell free DNA解析の試みと展望

肝脏和小肠移植中供体来源的无细胞 DNA 分析的试验和前景

• 发表时间: 2022
• 作者: 金森 洋樹;山田 洋平;梅山 知成;高橋 信博;加藤 源俊;長谷川 康;尾原 秀明;篠田 昌宏;入江 理恵;辻川 華子;大喜多 肇;西郷 健一;光永 滋樹;井ノ上 逸朗;黒田 達夫
• 通讯作者: 黒田 達夫

肝移植におけるドナー由来cell free DNA解析の試みと展望

肝移植中供体来源的无细胞 DNA 分析的试验与展望

• 发表时间: 2022
• 作者: Katsuki Miyazaki;Morine Y;Imura S;Ikemoto T;Saito Y;Yamada S;Tokuda K;Okikawa S;Yamashita S;Oya T;Tsuneyama K;Shimada M;篠田 昌宏
• 通讯作者: 篠田 昌宏