ロタウイルスの種間伝播動態の解明と農場への病原体侵入リスク指標への応用

轮状病毒种间传播动力学的阐明及其在农场病原体入侵风险指标中的应用

• 批准号: 20K15663
• 负责人: 西山 祥子
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: National Institute of Infectious Diseases (2022)Gifu University (2020-2021)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K15663/
• 关键词: ロタウイルス; 次世代シークエンスを用いた網羅的解析; Torque teno virus; ダニ媒介性脳炎ウイルス; 種間伝播; 野生動物; 家畜; 家畜衛生; 疫学; 数理モデル

ロタウイルスは11本の分節型遺伝子を持つ2本鎖RNAウイルスである。本研究では野生動物と家畜に感染するロタウイルスの遺伝子を解析し、その遺伝子の変化を観察することで、家畜が野生動物由来感染症に感染するリスクを評価する。今年度はロタウイルスの全ゲノム解析を効率よく行う手法を確立することとした。昨年度、ロタウイルスの感染が認められたイヌとハクビシンの糞便の上清から総RNAを抽出し、糞便に含まれる核酸をランダムプライマーにて増幅した。その後、次世代シークエンスにて全遺伝子解析を行った。現在、糞便中の遺伝子プールの中からロタウイルス遺伝子を抽出して解析中である。さらに2頭のタヌキと2頭のキツネの糞便サンプルからTorque teno virus（TTV）を4株検出し、その全遺伝子を解析した。その結果、３種類の新規TTVを検出した。また犬科動物に感染するTTVは３つのクラスターに分かれていることを明らかにした。現在、この結果を論文にて発表する準備中である。また、同様に野生動物における感染症流行を予測ため、北海道内で発生が認められているダニ媒介性脳炎ウイルス（TBE）の本州での流行状況をストレプタグELISAにより解析を行った。その結果、31％（16/52頭）のシカ、50％（1/2頭）のイノシシ、40％（2/5頭）のアナグマで血清学にTBE陽性となった。現在、中和試験にて確定診断を行う予定である。このように、複数の野生動物由来感染症のリスク調査を行った。今後は、これら感染症の確定診断と家畜への感染リスクについて考察する予定である。

The 11-segment DNA sequence contains the 2-segment RNA sequence. This study examines the genetic analysis and evolution of wildlife-derived infections in animals and livestock. This year's full analysis of the problem In the past year, the infection rate of human feces has increased. The analysis of the whole gene in the next generation is carried out. Now, in the feces of the child in the middle of the extraction of the child in the analysis In addition, 4 strains of Torque teno virus (TTV) from 2 Tajiki and 2 Kejiki feces carriers were detected and their complete genes were analyzed. The results, 3 types of new regulations TTV out. Canine infection is caused by TTV. Now, the results of this paper are in preparation. Prevalence prediction of infectious diseases in wild animals, detection of infectious diseases in Hokkaido and analysis of epidemic situation in Honshu by ELISA 31%(16/52) of the animals were serologically positive, 50%(1/2) of the animals were serologically positive, and 40%(2/5) of the animals were serologically positive. Now, try to confirm the diagnosis. A survey of wildlife-derived infections was conducted. In the future, the diagnosis of infectious diseases and the investigation of infectious diseases in livestock will be determined.