新生ポリペプチド鎖の空間的な局在化に伴ったmRNA分解機構と生理的意義の解明
新生ポリペプチド鎖の空間的な局在化に伴ったmRNA分解機構と生理的意義の解明
批准号:
20K15748
负责人:
石井 英治
金额:
$2.75万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-01 至 2024-03-31
中文摘要
本研究ではVemPの翻訳アレストを介した遺伝子発現制御における転写産物の振る舞いに焦点を当てて研究を行ってきた。R4年度では前年度に引き続き翻訳アレストを介した発現制御機構における「転写」と「翻訳」の連関に着目し研究を展開した。これまでの研究により、vemP-secDF2領域が転写される際、長さの異なる二種類の転写産物(長鎖産物;L, 短鎖産物; S)が蓄積することを見出している。前者はvemP-secDF2全長の転写産物であり、VemPの分泌能が損なわれ翻訳アレストが安定化する時、secDF2領域がRNaeseEの分解から保護され生じる。一方で、S産物はvemPとvemP ,secDF2間の遺伝子間領域の一部を有しているがその産生機構は明らかとなっていない。S産物の産生機構は①転写終結によるものと②エンドヌクレアーゼによる分解が考えられた。これらを検証するためにまず、vemP-secDF2を3'末端からtruncationした変異体を用いてS産物の産生に与える影響を確認した。その結果、S産物産生にかかわる領域が遺伝子間領域に存在することが明らかとなった。また、ヌクレアーゼによる分解の有無をin vitro転写系を用いた実験系により検証したところS産物様の転写産物が確認された。このことから、S産物は遺伝子間領域のモチーフ依存的かつヌクレアーゼ非依存的に産生されることが示唆され、転写終結により生じることが推測された。
英文摘要
本研究ではVemPの翻訳アレストを介した遺伝子発現制御における転写産物の振る舞いに焦点を当てて研究を行ってきた。R4年度では前年度に引き続き翻訳アレストを介した発現制御機構における「転写」と「翻訳」の連関に着目し研究を展開した。これまでの研究により、vemP-secDF2領域が転写される際、長さの異なる二種類の転写産物(長鎖産物;L, 短鎖産物; S)が蓄積することを見出している。前者はvemP-secDF2全長の転写産物であり、VemPの分泌能が損なわれ翻訳アレストが安定化する時、secDF2領域がRNaeseEの分解から保護され生じる。一方で、S産物はvemPとvemP ,secDF2間の遺伝子間領域の一部を有しているがその産生機構は明らかとなっていない。S産物の産生機構は①転写終結によるものと②エンドヌクレアーゼによる分解が考えられた。これらを検証するためにまず、vemP-secDF2を3'末端からtruncationした変異体を用いてS産物の産生に与える影響を確認した。その結果、S産物産生にかかわる領域が遺伝子間領域に存在することが明らかとなった。また、ヌクレアーゼによる分解の有無をin vitro転写系を用いた実験系により検証したところS産物様の転写産物が確認された。このことから、S産物は遺伝子間領域のモチーフ依存的かつヌクレアーゼ非依存的に産生されることが示唆され、転写終結により生じることが推測された。
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Xenogeneic silencing-mediated regulation of T3SS2 in Vibrio parahaemolyticus
副溶血弧菌中 T3SS2 的异种沉默介导的调控
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Andre Pratama, 石井英治、児玉年央、飯田哲也、松田重輝]
通讯作者:
石井英治、児玉年央、飯田哲也、松田重輝
Transcriptome Complexity of Vibrio parahaemolyticus revealed by direct RNA sequencing
直接 RNA 测序揭示副溶血弧菌转录组复杂性
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Minamino T, Kinoshita M, Morimoto YV, Namba K., アルカディ ムハッマド,石井 英治,Tat Truong Dang,元岡 大祐, 松田 重輝,飯田 哲也,児玉 年央,奥崎 大介]
通讯作者:
アルカディ ムハッマド,石井 英治,Tat Truong Dang,元岡 大祐, 松田 重輝,飯田 哲也,児玉 年央,奥崎 大介
H-NS mediates temperature- and salinity-dependent regulation of T3SS2 in Vibrio parahaemolyticus
H-NS 介导副溶血弧菌中 T3SS2 的温度和盐度依赖性调节
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[川原 史也, 山元 佳, 兼重 昌夫, 松崎 素道, 丸山 治彦, 永宗 喜三郎, Andre Pratama,石井 英治,児玉 年央,飯田 哲也,松田 重輝]
通讯作者:
Andre Pratama,石井 英治,児玉 年央,飯田 哲也,松田 重輝
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Mohamad Al Kadi, 石井英治、Dang Tat Truong、元岡大祐、松田重輝、飯田哲也、児玉年央、奥崎大介]
通讯作者:
石井英治、Dang Tat Truong、元岡大祐、松田重輝、飯田哲也、児玉年央、奥崎大介
A global regulator H-NS mediates temperature- and salinity-dependent regulation of type III secretion system 2 in Vibrio parahaemolyticus
全局调节剂 H-NS 介导副溶血弧菌 III 型分泌系统 2 的温度和盐度依赖性调节
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Andre Pratama, Eiji Ishii, Toshio Kodama, Tetsuya Iida, Shigeaki Matsuda]
通讯作者:
Shigeaki Matsuda
共 11 条
細菌における新規lncRNAの生化学的機能解析と生物学的役割の理解
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批准号:23K05637
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.08万
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财政年份:2023
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负责人:石井 英治
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依托单位:
新生ポリペプチド鎖による膜透過能の監視と転写-翻訳制御機構
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批准号:17J02501
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$2.58万
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财政年份:2017
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负责人:石井 英治
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依托单位:
海外基金