夜行性カエル類における視覚と体色の多様化プロセスの解明

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本年度は、新たなサンプルの採集、遺伝子解析、これまでに得られた次世代シーケンスデータの解析を行った。昨年度までの研究で、当初の対象種群において視覚に関わる遺伝子の塩基配列の多様性が予想以上に大きいことがわかり、系統発生の早い段階から多様化が始まったことが示唆された。そこで、本年度は、サンプリングの対象を拡大し、より広い系統のサンプルを収集した。本年度の初めには新型コロナウイルス感染症拡大防止のため野外調査の実施を見送ったケースもあったが、活動制限の緩和に伴い海外でのサンプリングを実施することができ、解析上重要な種を採集することができた。現地で調査許可・サンプル輸出許可を発行する機関が変更になった影響で手続きに時間を要しており、それらのサンプルを使った遺伝子解析は次年度に繰り越すこととなったが、サンプルの輸出および今後の解析の準備を進めた。また、これまでに得ていたサンプルを用いて次世代シーケンサーによる遺伝子解析を行い、新たな配列データを取得した。これについては、上記の海外サンプルのデータと合わせて塩基配列データの解析に供する予定である。そのほか、これまでに得られた次世代シーケンスデータの解析を進めた。核ゲノム決定に関しては、ゲノムサイズが大きいこと等の理由で予想より時間を要しているが、昨年度から継続して、スーパーコンピュータを使った新規アセンブリの計算を行った。発現遺伝子の解析については、昨年度までに仮説を支持する結果が得られていた。今年度は、解析手法の再検討を行ったほか、追加の解析を実施し、より信頼性が高い結果を得ることができ、多角的な仮説の検証が可能になった。追加データが得られた時点で論文原稿を国際学術誌に投稿するべく、原稿の準備を進めた。