浸潤性粘液腺癌の原因遺伝子解析研究

まずは長崎大学の約50症例を用いてHNF４αとTTF-1/Napsin Aの免疫染色を実施した。その結果、TTF-1/Napsin AとHNF4αには排他的な染色関係があることを発見した。また、その中でも10例において、両方の染色が混在している症例があることを発見した。これらには、通常の肺腺癌のなかでもAcinar subtypeのものが多く観察された。それらの周囲にはlepidicのcomponentが含まれないものが多く存在した。これは、lepidicからacinarに移行するtransformationと、Invasive mucinous adenocarcinomaにtransformationする症例の分子的背景が異なる可能性を示している。これを受け、lepidic componentからacinarに移行する症例7例のacinarとlepidicの部位（合計14か所）を切り出し、RNA シーケンスを実施し、さらにInvasive mucinous adenocarcinomaとacinar adenocarcinomaが混在する２症例のそれぞれの部位（合計4か所）、およびpureなinvasive mucinous adenocarcinomaの症例２例の合計20部位についてRNAシーケンスを実施した。しかし、解析データには多い量のアダプターダイマーが含まれており、ライブラリーのピークが低くなってしまっていた。アダプターダイマーの除去など別途必要なステップが生じたため、解析に時間がかかっている。

まずは長崎大学の約50症例を用いてHNF４αとTTF-1/Napsin Aの免疫染色を実施した。その結果、TTF-1/Napsin AとHNF4αには排他的な染色関係があることを発見した。また、その中でも10例において、両方の染色が混在している症例があることを発見した。これらには、通常の肺腺癌のなかでもAcinar subtypeのものが多く観察された。それらの周囲にはlepidicのcomponentが含まれないものが多く存在した。これは、lepidicからacinarに移行するtransformationと、Invasive mucinous adenocarcinomaにtransformationする症例の分子的背景が異なる可能性を示している。これを受け、lepidic componentからacinarに移行する症例7例のacinarとlepidicの部位（合計14か所）を切り出し、RNA シーケンスを実施し、さらにInvasive mucinous adenocarcinomaとacinar adenocarcinomaが混在する２症例のそれぞれの部位（合計4か所）、およびpureなinvasive mucinous adenocarcinomaの症例２例の合計20部位についてRNAシーケンスを実施した。しかし、解析データには多い量のアダプターダイマーが含まれており、ライブラリーのピークが低くなってしまっていた。アダプターダイマーの除去など別途必要なステップが生じたため、解析に時間がかかっている。