頭蓋内石灰化および嚢胞を伴う白質脳症の遺伝学的病態の解明

颅内钙化和囊肿白质脑病遗传病理学的阐明

• 批准号: 20K16862
• 负责人: 岩間 一浩
• 金额: $ 2.16万
• 依托单位: Yokohama City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K16862/
• 关键词: 白質脳症; 網羅的遺伝子解析

遺伝子解析を過去に行い、未同定となっていた症例の中で、LCC(leukoencephalopathy with calcification cyst)にあてはまる症例の探索を行った。その結果、 新規にLCCと類似した症例を検出した。本症例の全エクソーム解析では、新規の病原性候補遺伝子でde novoのヘテロ接合性バリアントが検出されていた。この遺伝子は、微小管のマイナス端を安定化して，ニューロンの極性・発生を制御する機能があるタンパク質をコードする機能を有しており、神経疾患の感受性遺伝子の可能性があった。今後はGenematcherを通じて、バリアントの登録を行い、類似した表現型の患者の報告がないか、情報を集める方針である。 LCC未同定症例の全ゲノム解析データについて、BreakDancerというバイオインフォマティクスツールを用いて、欠失・挿入領域の探索を行った。BreakDancerに よる欠失・挿入領域のコールは、始めは10,660ヶ所であったが、健常コントロールに見られないものは、1,311ヶ所であった。15リード以上の検出があるもの、 核ゲノムに位置するもので、フィルタリングを行うと1ヶ所に絞られた。このコールについて、Integrative Genomics Viewer (IGV)を用いて目視で確認し、約1 k-bpの欠失を 検出した。この欠失は、遺伝子のない領域のものであったため、Variant of unknown significance (VUS, 意義不明のバリアント)と考えられた が、全ゲノム解 析データを新しいツールで解析することで、多くのコールの中から1つの確かなコールを抽出することができた。今後、同様の解析方法を調整することで、真の病原性バリアント検出につながる可能性がある。

In the past, there was no agreement on the diagnosis of the disease, and the LCC (leukoencephalopathy with calcification cyst) was used to analyze the cases of the disease. The results of the test and the new specification LCC category are similar to those of the symptoms. In this case, the etiology and etiology of the disease were analyzed, and the new etiology, de novo, conjugacy, conjunctivities, pathogens, and pathogens were analyzed. The device, the microtubule, and the end of the microtubule are used to stabilize the device, and the control machine is capable of controlling the disease. The machine has the ability to treat diseases, mental disorders, and susceptibility. In the future, you will be notified of Genematcher reports and reports, and information sets will be available. LCC is not the same as the diagnosis of the disease in all cases, BreakDancerism in the field of exploration in the field. The BreakDancer has lost a lot of money in the field, since the beginning of 10660, and in the first half of the year. Above 15 days, please check the location, location, and location of the computer. Please contact me, Integrative Genomics Viewer (IGV), and confirm that about 1 k-bp is missing. In the field of information, you need to know that you are missing something, that is, Variant of unknown significance (VUS, the meaning of which is unknown). In the field, you need to know that you are missing something, and that you are not sure that you will be able to make a full analysis of the problem. In the future, the same method of analysis will be used to determine the possibility of pathogenicity.