子宮頸部胃型腺癌の治療標的となる遺伝子異常の同定

鉴定遗传异常作为宫颈胃腺癌的治疗靶点

• 批准号: 20K18235
• 负责人: 廣瀬 宗
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Jikei University School of Medicine
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K18235/
• 关键词: 子宮頸部胃型腺癌; 全エクソンシークエンス; 遺伝子異常; 子宮頸癌; がんゲノムシークエンス

子宮頸部胃型腺癌は，ヒトパピローマウイルス感染に非関連の組織型であり，予後不良であることが知られている．そのため，子宮頸部胃型腺癌の遺伝子異常を標的とした新規治療法の開発が求められている．本研究では子宮頸部胃型腺癌に着目し，その遺伝子異常解析を行う．また，子宮頸部胃型腺癌の臨床病理学的因子や予後情報から，発がん機構の解明と治療標的となる遺伝子異常を同定する．外科的に切除された子宮頸部胃型腺癌の症例14例のパラフィン固定標本からDNAを抽出し、j次世代シークエンサーを用いた全エクソンシークエンスを施行した。同定された遺伝子異常で、病的意義のあるものを抽出し、臨床病理学的因子との関連解析をした。ミスセンス変異がもっとも高頻度であり、variantのいくつかの傾向が示された。また、高頻度にみられる遺伝子異常を抽出した。変異の頻度を表すTumor Mutation Burdenは、既報やオープンソースのデータセットで示されている他がん種と比較して中等度であることが示された。そして、遺伝子異常の相互排他性、共存についていくつかの組み合わせが示され、Cancer Driver Geneの解析から、発がんやがん進化の機序に影響している可能性が示唆された。Mutational Signature解析では、遺伝子異常の傾向が示された。これらの結果から、子宮頸部胃型腺癌の発がんやがん進化のメカニズムの一端が示された。

Uterine neck type gastric adenocarcinoma は ヒ ト パ ピ ロ ー マ ウ イ ル に ス infection of masato even の tissue で あ り, to bad after で あ る こ と が know ら れ て い る. そ の た め, uterine neck type gastric adenocarcinoma の heritage 伝 child abnormal を mark と し た の open new rules therapy 発 が o め ら れ て い る. In this study, で で uterine cervical gastric adenocarcinoma に results in に, そ, abnormal analysis of 伝 offspring を rows う. ま た, uterine neck type gastric adenocarcinoma の factor of clinical pathology after や to intelligence か ら, 発 が ん institutions の interpret と therapeutic target と な る heritage 伝 child abnormal を be す る. に of surgical excision さ れ た uterine neck type gastric adenocarcinoma cases の 14 cases の パ ラ フ ィ ン fixed specimens か ら を DNA extraction し, j nextgen シ ー ク エ ン サ ー を with い た full エ ク ソ ン シ ー ク エ ン ス を imposed し た. The same determination of された residual 伝 sub-abnormalities で, the significance of the disease <s:1> ある <s:1> を を extraction <s:1>, the correlation analysis of the factors of clinical pathology と <e:1> を た. The frequency of the が スセ ス ス variation が っと っと された high frequency であ, variant <s:1> く く が tendency が indicates された. Youdaoplaceholder0, high-frequency にみられる left 伝 sub-anomalies を extracted た た. - different の frequency を table す Tumor Mutation Burden は, both reported や オ ー プ ン ソ ー ス の デ ー タ セ ッ ト で shown さ れ て い る he が ん kind と compare し て medium degree で あ る こ と が shown さ れ た. そ し て, but 伝 abnormal の mutually exclusive and coexistence に つ い て い く つ か の group み close わ せ が shown さ れ, Cancer Driver Gene の parsing か ら, 発 が ん や が ん の machine sequence evolution に influence し て い が る possibility in stopping さ れ た. The Mutational Signature parses で で, and the 伝 sub-exception <s:1> tends to が indicate された. The results of れら れら show that ら and uterine cervical gastric adenocarcinoma がんやがん have undergone がんやがん evolution メカニズム one end of が indicates された.

项目成果

Genomic alteraion profiles of Gastric-type cervical adenocarcinoma

胃型宫颈腺癌的基因组改变谱

• 发表时间: 2022
• 作者: Deguchi Mari;Tsuji Shunichiro;Katsura Daisuke;Kasahara Kyoko;Kimura Fuminori;Murakami Takashi;Sou Hirose
• 通讯作者: Sou Hirose

Genomic alteration profiles of Gastric-type cervical adenocarcinoma

胃型宫颈腺癌的基因组改变谱

• 发表时间: 2022
• 作者: Yokogi Kyoka;Goto Yuki;Otsuka Mai;Ojima Fumiya;Kobayashi Tomoe;Tsuchiba Yukina;Takeuchi Yu;Namba Masumi;Kohno Mayumi;Tetsuka Minami;Takeuchi Sakae;Matsuyama Makoto;Aizawa Sayaka;廣瀬 宗
• 通讯作者: 廣瀬 宗