個人識別を目的とした試料の劣化に頑強な新規微生物叢解析法の開発
個人識別を目的とした試料の劣化に頑強な新規微生物叢解析法の開発
批准号:
20K18991
负责人:
豊間根 耕地
金额:
$2.58万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-01 至 2024-03-31
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研究代表者はこれまでに、新規個人識別法の開発を目標として、皮膚微生物叢中に存在する真正細菌が保持するCRISPRに着目し、CRISPRのスペーサー配列を指標とした新規微生物叢解析法を構築してきた。これまでに、特にレンサ球菌の保持するCRISPRが個人識別に有用であることを見出し、前年度までに解析法の最適化を進めてきた。本年度はCRISPR配列解析の個人識別における有用性を検討するために、ヒトの皮膚スワブから抽出したDNAについて、次世代シーケンサーMiSeqによるレンサ球菌CRISPRの配列解析を実施し、個人識別に用いられているDNA型検査試薬、GlobalFilerによるDNA型検査との比較を行った。DNA型検査を実施した試料(皮膚スワブ及び唾液)について、同一試料のレンサ球菌CRISPRの配列を解析したところ、皮膚スワブのレンサ球菌CRISPRの配列情報は同一個人に由来する試料間で類似性が高いことが示され、先行研究課題において示したレンサ球菌CRISPR配列解析の個人識別における有効性が再現された。また、レンサ球菌CRISPRの配列解析が個人識別に有効と考えられた試料について、一部の試料はDNA型検査において一部の座位でアレルが検出されない場合があった。このことは、ヒトDNA型検査でアレルが不検出になるなど、個人識別に十分な情報が得られない場合でも、CRISPRの配列情報が得られる可能性を示唆するものと考えられる。
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Optimization of microbial DNA extraction from human skin samples for CRISPR typing
优化从人体皮肤样本中提取微生物 DNA 以进行 CRISPR 分型
DOI:
10.1016/j.fsir.2022.100259
发表时间:
2022
期刊:
Forensic Science International: Reports
影响因子:
--
作者:
[Toyomane Kochi, Yokota Ryo, Watanabe Ken, Akutsu Tomoko, Asahi Ai, Kubota Satoshi]
通讯作者:
Kubota Satoshi
CRISPRの多様性解析による個人識別法の開発
利用 CRISPR 多样性分析开发个人识别方法
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[豊間根耕地, 横田亮, 渡邊賢, 阿久津智子, 旭愛, 窪田聡]
通讯作者:
窪田聡
細菌叢のメタCRISPR解析による体液特異的個人識別法の開発
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批准号:24K20264
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2024
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负责人:豊間根 耕地
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依托单位:
炭疽菌の病原因子発現制御機構に関わる転写調節因子の分子機能の解明
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批准号:17J01377
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.22万
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财政年份:2017
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负责人:豊間根 耕地
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依托单位:
海外基金