個人識別を目的とした試料の劣化に頑強な新規微生物叢解析法の開発

开发一种新的微生物组分析方法，该方法能够有效防止样本变质，以进行个人身份识别

• 批准号: 20K18991
• 负责人: 豊間根 耕地
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: National Research Institute of Police Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K18991/
• 关键词: 個人識別; 微生物叢; CRISPR

研究代表者はこれまでに、新規個人識別法の開発を目標として、皮膚微生物叢中に存在する真正細菌が保持するCRISPRに着目し、CRISPRのスペーサー配列を指標とした新規微生物叢解析法を構築してきた。これまでに、特にレンサ球菌の保持するCRISPRが個人識別に有用であることを見出し、前年度までに解析法の最適化を進めてきた。本年度はCRISPR配列解析の個人識別における有用性を検討するために、ヒトの皮膚スワブから抽出したDNAについて、次世代シーケンサーMiSeqによるレンサ球菌CRISPRの配列解析を実施し、個人識別に用いられているDNA型検査試薬、GlobalFilerによるDNA型検査との比較を行った。DNA型検査を実施した試料（皮膚スワブ及び唾液）について、同一試料のレンサ球菌CRISPRの配列を解析したところ、皮膚スワブのレンサ球菌CRISPRの配列情報は同一個人に由来する試料間で類似性が高いことが示され、先行研究課題において示したレンサ球菌CRISPR配列解析の個人識別における有効性が再現された。また、レンサ球菌CRISPRの配列解析が個人識別に有効と考えられた試料について、一部の試料はDNA型検査において一部の座位でアレルが検出されない場合があった。このことは、ヒトDNA型検査でアレルが不検出になるなど、個人識別に十分な情報が得られない場合でも、CRISPRの配列情報が得られる可能性を示唆するものと考えられる。

The researchers proposed a new method for the development of CRISPR and the establishment of a new method for the analysis of microflora. CRISPR is useful for personal identification and optimization of analysis methods in previous years. This year, we conducted a comparison of CRISPR alignment analysis, DNA typing, and GlobalFiler DNA typing in the context of the usefulness of CRISPR alignment analysis for personal identification. DNA typing was carried out on samples (skin and saliva), and the CRISPR alignment analysis of the same sample was carried out. The CRISPR alignment information of the same sample was highly similar to that of the same individual. The CRISPR alignment analysis of the same sample was carried out on the previous research topic. The sequence analysis of CRISPR for individual identification is carried out in the presence of a sample, a part of the sample is carried out in the presence of a locus, and a part of the sample is carried out in the presence of a locus. This is the case when the CRISPR alignment information is available, and the CRISPR alignment information is available.

项目成果

Optimization of microbial DNA extraction from human skin samples for CRISPR typing

优化从人体皮肤样本中提取微生物 DNA 以进行 CRISPR 分型

• DOI: 10.1016/j.fsir.2022.100259
• 发表时间: 2022
• 期刊: Forensic Science International: Reports
• 作者: Toyomane Kochi;Yokota Ryo;Watanabe Ken;Akutsu Tomoko;Asahi Ai;Kubota Satoshi
• 通讯作者: Kubota Satoshi

CRISPRの多様性解析による個人識別法の開発

利用 CRISPR 多样性分析开发个人识别方法

• 发表时间: 2021
• 作者: 豊間根耕地;横田亮;渡邊賢;阿久津智子;旭愛;窪田聡
• 通讯作者: 窪田聡