Comprehensive prediction of cryptic binding sites by multi-task deep learning

通过多任务深度学习综合预测神秘结合位点

• 批准号: 20K19917
• 负责人: Yanagisawa Keisuke
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Tokyo Institute of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K19917/
• 关键词: リガンド結合部位予測; 隠された結合部位; 深層学習; マルチタスク学習; 畳み込みニューラルネットワーク; 網羅的予測; 共溶媒分子動力学法; マルチタスク深層学習

项目成果

分子動力学シミュレーション軌跡データからの環状ペプチドの膜透過性と相関が高い特徴量の抽出

从分子动力学模拟轨迹数据中提取与环肽膜通透性高度相关的特征

• 发表时间: 2022
• 作者: 能祖 雄大;杉田 昌岳;藤江 拓哉;柳澤 渓甫;大上 雅史;秋山 泰
• 通讯作者: 秋山 泰

EXPRORER: Rational Cosolvent Set Construction Method for Cosolvent Molecular Dynamics Using Large-Scale Computation

EXPRORER：利用大规模计算的共溶剂分子动力学的合理共溶剂集构建方法

• DOI: 10.1021/acs.jcim.1c00134
• 发表时间: 2021
• 期刊: Journal of Chemical Information and Modeling
• 影响因子: 5.6
• 作者: Yanagisawa Keisuke;Moriwaki Yoshitaka;Terada Tohru;Shimizu Kentaro
• 通讯作者: Shimizu Kentaro

Virtual Screening Methods with a Protein Tertiary Structure for Drug Discovery

用于药物发现的蛋白质三级结构虚拟筛选方法

• DOI: 10.11234/jsbibr.2021.9
• 发表时间: 2021
• 期刊: JSBi Bioinformatics Review
• 作者: 春山 知生;前田 圭介;藤後 廉;小川 貴弘;長谷山 美紀;柳澤 渓甫
• 通讯作者: 柳澤 渓甫

分子動力学シミュレーションに基づいた環状ペプチドの膜透過率の大規模予測

基于分子动力学模拟的环肽膜渗透性大规模预测

• 发表时间: 2021
• 作者: 杉田 昌岳;杉山 聡;藤江 拓哉;吉川 寧;柳澤 渓甫;大上 雅史;秋山 泰
• 通讯作者: 秋山 泰

新たなデータセットによる長距離フラグメントリンキング手法の再評価

使用新数据集重新评估远程片段链接方法

• 发表时间: 2021
• 作者: 津嶋 佑旗;柳澤 渓甫;大上 雅史;秋山 泰
• 通讯作者: 秋山 泰