サクラクローン品種をモデルとした代謝エピゲノムによる樹齢推定

以樱花克隆品种为模型，利用代谢表观基因组估计树龄

• 批准号: 20K21344
• 负责人: 松本 麻子
• 金额: $ 3.99万
• 依托单位: Forest Research and Management Organization
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-07-30 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K21344/
• 关键词: サクラクローン品種; メチル化; メタボローム; エピゲノム; クローン品種

サクラ栽培品種を対象に、加齢によって生じるDNAの修飾とそれに伴うメタボロームの変化を捉える課題である。エピゲノム解析では、全ゲノムバイサルフェイトシークエンスの結果から遺伝子の転写に影響を及ぼす可能性が高い領域に起こるメチル化に焦点を当て、加齢に伴うメチル化の質的量的変化をゲノムワイドに検出する。環境や樹齢が異なることによるDNAのメチル化の違いを明らかにするために、サクラ属の単一クローン品種10検体について、メチル化解析を実施した。全ゲノムの平均メチル化レベル、総メチル-シトシン量に占めるメチル化の割合、各染色体のメチル化シトシン密度、メチル化パターンの個体間の違いについて解析した。その結果、特に個体間比較で得られる異常ともみなされるメチル化の違いについては、異なる環境の同一品種間よりも同一環境の異なる品種間の方が、検出されるメチル化領域が多いことが明らかになった。それらメチル化領域については関連遺伝子の探索を行い、リノール酸代謝関連遺伝子などメチル化の影響を受けている可能性が有意に認められた。

The research on DNA modification of cultivated varieties is carried out in the following ways: The results of the analysis and analysis of all kinds of products include the influence and possibility of product development in high areas, the focus of product development, and the qualitative transformation of product development. The analysis of DNA in different species of trees and trees is carried out. The average number of chromosomes, the number of chromosomes, and the number of chromosomes. The results show that there are many differences between different species in different environments, and there are many differences between different species in different environments. The study of the relationship between the two genes in the field of metabolism and the possibility of their influence on the metabolism of hydrochloric acid was carried out intentionally.