サクラクローン品種をモデルとした代謝エピゲノムによる樹齢推定

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サクラ栽培品種を対象に、加齢によって生じるDNAの修飾とそれに伴うメタボロームの変化を捉える課題である。エピゲノム解析では、全ゲノムバイサルフェイトシークエンスの結果から遺伝子の転写に影響を及ぼす可能性が高い領域に起こるメチル化に焦点を当て、加齢に伴うメチル化の質的量的変化をゲノムワイドに検出する。環境や樹齢が異なることによるDNAのメチル化の違いを明らかにするために、サクラ属の単一クローン品種10検体について、メチル化解析を実施した。全ゲノムの平均メチル化レベル、総メチル-シトシン量に占めるメチル化の割合、各染色体のメチル化シトシン密度、メチル化パターンの個体間の違いについて解析した。その結果、特に個体間比較で得られる異常ともみなされるメチル化の違いについては、異なる環境の同一品種間よりも同一環境の異なる品種間の方が、検出されるメチル化領域が多いことが明らかになった。それらメチル化領域については関連遺伝子の探索を行い、リノール酸代謝関連遺伝子などメチル化の影響を受けている可能性が有意に認められた。