Metatranscriptome analysis clarify virulence factors of osteomyelitis of the jaw

宏转录组分析阐明颌骨骨髓炎的毒力因子

• 批准号: 20K23021
• 负责人: 加地 博一
• 金额: $ 1.83万
• 依托单位: Tokyo Medical and Dental University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-09-11 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K23021/
• 关键词: 顎骨骨髄炎; 複合感染症; メタ16S解析; 共起ネットワーク; メタゲノム解析; メタトランスクリプトーム解析; メタトランスクリプトーム; 顎骨骨髄炎細菌叢

顎骨骨髄炎では種々の口腔細菌種が協同して病変形成に関わっている考えられている．しかし、従来の研究は培養可能な一部の細菌種のみを調べる手法に依存しているため，疾患に関与する細菌群を網羅的に解析することや、それらの細菌の活動性を評価することが困難であった。本研究では、まずメタ16S解析を行うことで顎骨骨髄炎の病変に存在する細菌群を網羅的に同定し、さらには16S rDNAと16S rRNAの比を計算することで、細菌群を構成する各細菌腫の活動性を評価した。その結果、従来の研究で顎骨骨髄炎のCore microbiomeと同定された細菌腫であっても、全ての細菌腫の活動性が高いわけではないことが明らかとなった。さらに、共起ネットワーク解析では、活動性の高い細菌種だけでなく活動性の低い細菌種、マイナーな細菌腫がともにネットワークを構築することで、頑強性を保有するネットワークが形成されている可能性が示唆された。

Osteoarthritis of the jaw is caused by a combination of oral bacterial species and disease formation. In recent years, it has been difficult to evaluate the activity of bacteria in culture, depending on the method of regulation of some bacterial species, and the analysis of bacterial populations related to diseases. In this study, we analyzed the presence of 16S rDNA and 16S rRNA in osteomyelitis and evaluated the activity of each bacterial tumor. The results of this study show that the activity of the Core microbiome of osteomyelitis in the jaw is high. The high activity bacterial species and the low activity bacterial species have been analyzed and the high activity bacterial species and the low activity bacterial species have been analyzed.