课题基金 / 基金详情

Study of protein performance modification based on canonical molecular orbital analysis

Study of protein performance modification based on canonical molecular orbital analysis
基于正则分子轨道分析的蛋白质性能修饰研究
批准号：
21H02056
负责人：
佐藤 文俊
金额：
$11.73万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02056/
关键词：
正準分子軌道タンパク質密度汎関数法タンパク質工学タンパク質性能改変正準分子軌道計算

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项目成果

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本研究の目的は、タンパク質の分子軌道を制御する機構を明らかにし、これに基づきタンパク質の化学的性質を改変する基盤技術を構築することである。我々は含金属タンパク質を対象とした正準分子軌道計算を達成できる量子化学計算プログラムProteinDFならびにQCLO法に基づく大規模分子自動計算プログラムQCLObotを開発している。タンパク質をまるごと量子化学的に取り扱うことのできるProteinDFは、局所基底関数としてGauss型基底関数展開を利用することで原子1つ1つが系全体の電子状態に与える影響を議論することができる。一方QCLObotは、複雑なヘテロ分子を含むタンパク質でも量子化学計算の収束解に近い高精度な初期値を作成するプログラムである。これまでに達成してきたタンパク質の正準分子軌道計算による結果を観察すると、その分子軌道が広範囲にわたって広がっているものと、広がらずに局在化しているものがあることがわかってきた。本年度は分子軌道対応法の開発をおこなった。
期刊论文(15)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
ACE2におけるスパイクタンパク質結合部位の電子状態
ACE2 中刺突蛋白结合位点的电子态
DOI： --
发表时间： 2022
期刊：
影响因子： --
作者： [平野敏行, 佐藤文俊]
通讯作者： 佐藤文俊
Analysis of Electronic Structure of Photoactive Yellow Protein by Canonical Molecular Orbitals Calculation
规范分子轨道计算分析光活性黄色蛋白的电子结构
DOI： 10.11188/seisankenkyu.73.157
发表时间： 2021
期刊： SEISAN KENKYU
影响因子： --
作者： [前田 大陸, 平野 敏行, 佐藤 文俊]
通讯作者： 佐藤 文俊
Multiple mutations in RNA polymerase β-subunit gene (rpoB) in Streptomyces incarnatus NRRL8089 enhance production of antiviral antibiotic sinefungin: modeling rif cluster region by density functional theory
Streptomyces incarnatus NRRL8089 中 RNA 聚合酶 β 亚基基因 (rpoB) 的多个突变增强了抗病毒抗生素 Sinefungin 的产量：通过密度泛函理论对 rif 簇区域进行建模
DOI： 10.1093/bbb/zbab011
发表时间： 2021
期刊： Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
影响因子： --
作者： [Ogawa Saori, Shimidzu Hitomi, Fukuda Koji, Tsunekawa Naoki, Hirano Toshiyuki, Sato Fumitoshi, Yura Kei, Hasunuma Tomohisa, Ochi Kozo, Yamamoto Michio, Sakamoto Wataru, Hashimoto Kentaro, Ogata Hiroyuki, Kanao Tadayoshi, Nemoto Michiko, Inagaki Kenji, Tamura Takashi]
通讯作者： Tamura Takashi
Interaction energy analysis based on canonical Kohn-Sham molecular orbitals calculation of protein
基于蛋白质经典 Kohn-Sham 分子轨道计算的相互作用能分析
DOI： 10.1063/5.0047812
发表时间： 2021
期刊： AIP Conference Proceedings
影响因子： --
作者： [Hirano Toshiyuki, Sato Fumitoshi]
通讯作者： Sato Fumitoshi
共 14 条
    多電子複雑系における電子移動の密度汎関数法と経路積分法による研究
    • 批准号：
      07236235
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $1.09万
    • 财政年份：
      1995
    • 负责人：
      佐藤 文俊
    • 依托单位：
      Kyushu Institute of Technology
    経路積分法を用いた金属蛋白質の電子移動経路シミュレーション
    • 批准号：
      05858094
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
    • 资助金额：
      $0.51万
    • 财政年份：
      1993
    • 负责人：
      佐藤 文俊
    • 依托单位：
      Kyushu Institute of Technology
    海外基金