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Identification of ncRNA-mediated genetic factors regulating dormancy and blooming in Rosaceae fruit trees

ncRNA介导的蔷薇科果树休眠和开花遗传因子的鉴定

基本信息

批准号：
21H02186
负责人：
山根久代
金额：
$ 11.23万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

バラ科果樹において、重要農業形質のひとつであり気候変動の影響を受ける開花期には、花成発達期間ならびに休眠期間（低温要求量と高温要求量）が構成要素として影響する。本研究の目的は、QTLやGWASなどの遺伝解析により低温要求性・高温要求性・萌芽日・開花日の遺伝因子を同定しその機能を解明することである。今年度の具体的な成果は以下の通りである。まず、高温要求性制御候補因子として同定したリンゴFLC-likeの転写制御機構に関して新たな知見を獲得した。すなわち、低温遭遇による発現上昇には植物の代表的なヒストン修飾機構であるH3K4me3のレベル上昇とH3K27me3のレベル低下が関与することを明らかにした。これは、エピジェネティック制御機構が休眠に関与することを支持する結果である。またウメの発芽日を制御するQTL領域に座乗する遺伝子同定のため、ウメ‘南高’ゲノムをロングリードシークエンス技術を用いて配列決定した。現在アッセンブルとアノテーションを進めており、来年度中には遺伝子情報を明らかにできる予定である。未同定である高温要求性制御遺伝領域をQTLとGWASで明らかにするため、ウメF1分離集団や100個体以上のウメコレクションを対象に表現型調査を実施した。今後遺伝解析のデータとして活用することができる。さらに、ニホンナシFLC遺伝子群の解析を進め、休眠後期に発現が増加するFLC遺伝子を同定した。遺伝子発現における温度応答性を調査中である。以上より、今年度は、休眠芽の温度応答性におけるエピジェネティック制御の関与を明らかにし、温度要求性遺伝因子同定に向けたゲノム情報・表現型情報を整備・獲得できた。

In the department of agriculture, there is a significant impact on the essential factors during the dormancy period (low temperature requirements and high temperature requirements) during the period of blooming and dormancy (low temperature requirements and high temperature requirements). The purpose of this study is to analyze the relationship between low temperature, sexual high temperature, sexual high temperature, flowering, blooming, temperature, temperature, The following are the specific "achievements" for this year. The temperature and temperature requirements are the same as that of the FLC-like system. The control agency is responsible for new information. The temperature of the plant is low and the temperature is low. Now, the H3K4me3 plant is the representative of the repair machine. The H3K27me3 is low and the temperature is low. The hibernating mechanism and the monitoring system are in support of the operation results. In the field of QTL, the system is designed to be the same as that in the south, and the technology is used to determine the level of technology. Now that we are in the middle of the year, we will be able to make clear that we are going to be in the middle of next year. It is not the same as that in the field of high temperature control, QTL, GWAS, and F1 separation sets. There are more than 100 people in the separation set. In the future, we will analyze how to make use of it. In the post-dormancy period, you will be able to add the subgroup of the FLC cluster in the post-dormancy period to determine the same level. The temperature is very sensitive to the temperature. The temperature of the above, this year, dormant buds, temperature, temperature, temperature and temperature requirements.