Structural and Functional analysis on tripartite ABC transporters.

三方 ABC 转运蛋白的结构和功能分析。

• 批准号: 21H02412
• 负责人: 村上 聡
• 金额: $ 11.15万
• 依托单位: Tokyo Institute of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02412/
• 关键词: 構造生物学; 膜輸送; X線結晶構造解析; 膜蛋白質; 薬剤耐性化; 薬剤耐性

三者複合体を形成し機能するABC輸送体をターゲットとする本研究課題では、主に二つの輸送系を取り扱う。共にグラム陰性細菌由来の輸送系ではあるものの、一つは私たちのグループがこれまで20年間以上取り組んできた多剤排出に関わる三者複合体形成型ABC排出トランスポーターである。この種のABC輸送体は2017年に我々が世界に先駆けて構造を明らかにした。これはABC輸送体としては新たに構造が明らかになったものであり、初のType-VII型ABC輸送体としてカテゴライズされた。また、二つ目のターゲットとしてType-VIIにカテゴライズされつつも多剤排出ではなく外膜蛋白質の輸送系に関わるものも存在する。これが二つ目のターゲットである。2022年度については、2021年度からの繰越予算による2021年度計画の研究内容とあわせて、当該年度計画の内容についても進めることとなった。今年度についてはType-VII型多剤排出ABC輸送体の基質複合体についての結晶化を進めると共に、外膜蛋白質輸送系に属する蛋白質群の構造解析を進めた。外膜蛋白質輸送系において構造情報が未だ無くその様相が不明であるものは、外膜蛋白質がペリプラズム空間を輸送されて行く有様である。外膜蛋白質輸送系では多剤排出輸送体系に於けるペリプラズム・アダプター蛋白質に相当する部分であるペリプラズム・シャペロン蛋白質が外膜蛋白質と複合体を形成し、水溶性化することでペリプラズム空間を拡散して行く。この姿を明らかにするために結晶解析を進めた。外膜蛋白質のN末にはフレキシブルな領域があるが、この部分も含めた全長蛋白質どうしの複合体の結晶解析を複数の晶系で完了させた。これらの構造の差違をさらに調査するために、X線小角散乱を用いた溶液構造解析を進めた。最終年度での取りまとめを計画している。

This research topic is about the selection of the transport system between the two components. The transport system of the origin of negative bacteria in a total of more than 20 years, the formation of a complex of three ABC discharge type This kind of ABC transport body will be launched in 2017, and the world's leading structure will be launched in the future. A new type of ABC transporter was constructed. Type VII is a type of protein transport system associated with the removal of multiple proteins from outer membrane.これが二つ目のターゲットである。2022 annual plan, 2021 annual plan, 2021 annual plan This year, the structure analysis of protein groups belonging to the matrix complex of Type-VII multi-agent ABC transporter was improved. Outer membrane protein transport system structure information is not divided into two parts, the phase is unknown, the outer membrane protein transport system space is divided into two parts, the phase is unknown, and the phase is unknown. The outer membrane protein transport system is composed of multiple components. The protein transport system is composed of components corresponding to the outer membrane protein complex. The components are soluble in water and dispersed in space. This is the first time I've seen this. The crystal structure of the protein complex in the outer membrane was analyzed. The structure of the structure of the investigation, X-ray small angle scattered in the solution of structural analysis. The final year is planned.

项目成果

The University of Cambridge(英国)

剑桥大学（英国）

Bugworks, Inc.(インド)

Bugworks, Inc.（印度）

Therapeutic Protein Targets for Drug Discovery and Clinical Evaluation: Bio-crystallography and Drug Design

药物发现和临床评价的治疗性蛋白质靶点：生物晶体学和药物设计

• 发表时间: 2022
• 作者: Okada;U.;Murakami;S.
• 通讯作者: S.

Los Alamos National Laboratory/New Mexico Consortium/Northern Arizona University(米国)

洛斯阿拉莫斯国家实验室/新墨西哥联盟/北亚利桑那大学（美国）

Crystal structures of multidrug efflux transporters from Burkholderia pseudomallei suggest details of transport mechanism.

• DOI: 10.1073/pnas.2215072120
• 发表时间: 2023-07-18
• 期刊: PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
• 影响因子: 11.1
• 作者: Kato, Takaaki;Okada, Ui;Hung, Li-Wei;Yamashita, Eiki;Kim, Heung-Bok;Kim, Chang-Yub;Terwilliger, Thomas C.;Schweizer, Herbert P.;Murakami, Satoshi
• 通讯作者: Murakami, Satoshi