ポリジェニックリスクスコアを用いた自殺リスクの予測と遺伝学的解明
ポリジェニックリスクスコアを用いた自殺リスクの予測と遺伝学的解明
批准号:
21H02852
负责人:
菱本 明豊
金额:
$11.07万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
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自殺についての遺伝学的知見の獲得は、自殺者試料の収集が困難なため他精神科領域に比して世界的に遅れていた。申請者らは国内唯一・単一機関として世界最大規模の自殺者DNA試料とゲノムワイド関連解析(genome-wide association study; GWAS)データを有し、GWASデータから算出できる個人ごとの自殺ポリジェニックリスクスコア(polygenic risk score; PRS)が、個人の自殺リスクを予測できる可能性を見出した。本研究では、自殺者/自殺未遂者試料の追加GWASを実施し計1,800例の日本人自殺者/自殺未遂者(及び20,000例の非自殺者)のGWASデータを用いることで、①日本人集団において自殺PRSがどの程度の確度で自殺リスクを予測できるか、②アジア人種において各精神疾患や喫煙・飲酒・身長・体重などの様々なヒト表現型がどの程度自殺と遺伝的リスクを共有しているか、の2点を精細に検討する。R4年度末までに約550例の自殺関連試料の追加収集・大部分のGWASデータ取得を実施し、BBJの非自殺者5,000例のコントロールデータとの統合中であり、最終年度の解析に向けて順調にサンプルサイズのスケールアップ・準備を進めることができた。また予備的解析結果において、白人集団におけるうつ病・統合失調症と自殺との遺伝的リスク共有度に比して、アジア人種におけるうつ病・統合失調症と自殺との遺伝的リスク共有度が弱い可能性を見出している。
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Mapping the genetic architecture of suicide attempt and suicide death using polygenic risk scores for clinically-related psychiatric disorders and traits
使用临床相关精神疾病和特征的多基因风险评分绘制自杀未遂和自杀死亡的遗传结构
DOI:
10.1017/s0033291721004700
发表时间:
2021
期刊:
Psychological Medicine
影响因子:
6.9
作者:
[Otsuka Ikuo, Galfalvy Hanga, Guo Jia, Akiyama Masato, Rujescu Dan, Turecki Gustavo, Hishimoto Akitoyo, Mann J. John]
通讯作者:
Mann J. John
日本人自殺者のゲノムワイド関連解析
日本自杀事件的全基因组关联分析
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[大塚郁夫, 菱本明豊.]
通讯作者:
菱本明豊.
DOI:
10.1016/j.psychres.2021.113967
发表时间:
2021-04
期刊:
Psychiatry Research
影响因子:
11.3
作者:
[Keita Idemoto;T. Niitsu;Tatsuki Hata;T. Ishima;S. Yoshida;K. Hattori;Tadasu Horai;Ikuo Otsuka;H. Yamamori;S. Toda;Yosuke Kameno;K. Ota;Y. Oda;Atsushi Kimura;T. Hashimoto;N. Mori;M. Kikuchi;Y. Minabe;R. Hashimoto;A. Hishimoto;K. Nakagome;K. Hashimoto;M. Iyo]
通讯作者:
Keita Idemoto;T. Niitsu;Tatsuki Hata;T. Ishima;S. Yoshida;K. Hattori;Tadasu Horai;Ikuo Otsuka;H. Yamamori;S. Toda;Yosuke Kameno;K. Ota;Y. Oda;Atsushi Kimura;T. Hashimoto;N. Mori;M. Kikuchi;Y. Minabe;R. Hashimoto;A. Hishimoto;K. Nakagome;K. Hashimoto;M. Iyo
DOI:
10.1001/jamapsychiatry.2022.3896
发表时间:
2022-12-14
期刊:
JAMA PSYCHIATRY
影响因子:
25.8
作者:
[Kimbrel, Nathan A., Ashley-Koch, Allison E., Hauser, Michael A.]
通讯作者:
Hauser, Michael A.
DOI:
10.1038/s41588-022-01054-7
发表时间:
2022-05
期刊:
NATURE GENETICS
影响因子:
30.8
作者:
[Ruan, Yunfeng, Lin, Yen-Feng, Feng, Yen-Chen Anne, Chen, Chia-Yen, Lam, Max, Guo, Zhenglin, He, Lin, Sawa, Akira, Martin, Alicia R., Qin, Shengying, Huang, Hailiang, Ge, Tian]
通讯作者:
Ge, Tian
共 28 条
若者を自殺に追い込む生物学的異常と可逆性:エピゲノム・シングルセルダイナミクス
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批准号:24K02383
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.9万
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财政年份:2024
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负责人:菱本 明豊
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依托单位:
A worldwide study of genetic factor for suicide
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批准号:20KK0194
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项目类别:Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
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资助金额:$11.81万
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财政年份:2020
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负责人:菱本 明豊
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依托单位:
国内基金
海外基金
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整合GWAS与单细胞多组学解析克罗恩病纤维化中肠道菌群-宿主互作机制研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:魏艳玲
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依托单位:
基于全基因组关联分析(GWAS) 的林麝麝香质量相关基因挖掘
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:郑瑶
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依托单位:
基于深度学习的冬虫夏草寄主生态型GWAS解析与精准育种策略研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:卫秋阳
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依托单位:
基于GWAS数据的子宫内膜异位症因果因素筛选及其多因素风险预测模型的构建与临床验证
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批准号:2025JJ80570
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:粟艳林
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依托单位:
基于NIRS和GWAS分析的甘薯品质性状关键基因挖掘及功能研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:15.0万元
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批准年份:2024
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负责人:唐朝臣
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依托单位:
基于 GWAS 策略研究儿童抗结核药物肝损伤药物基因组
学标志物及风险预测模型
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批准号:2024JJ8155
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:何利
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依托单位:
基于GWAS分析的桂花结实性状关联基因OfAGL62的功能验证与调控网络研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:
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依托单位:
基于GWAS和WGCNA挖掘调控板栗种仁淀粉含量的关键基因
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:
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依托单位:
堇叶碎米荠种质资源遗传多样性及植株性状的全基因组关联分析(GWAS)
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:
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依托单位:
基于 GWAS 和多组学策略的红花类黄酮
HSYA 合成基因的功能解析
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批准号:Y24C020010
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:吴智华
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依托单位: