ポリジェニックリスクスコアを用いた自殺リスクの予測と遺伝学的解明

使用多基因风险评分预测和遗传阐明自杀风险

• 批准号: 21H02852
• 负责人: 菱本 明豊
• 金额: $ 11.07万
• 依托单位: Kobe University (2023)Yokohama City University (2021-2022)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02852/
• 关键词: 自殺; GWAS; ポリジェニックリスクスコア; ゲノムワイド関連解析

自殺についての遺伝学的知見の獲得は、自殺者試料の収集が困難なため他精神科領域に比して世界的に遅れていた。申請者らは国内唯一・単一機関として世界最大規模の自殺者DNA試料とゲノムワイド関連解析（genome-wide association study; GWAS）データを有し、GWASデータから算出できる個人ごとの自殺ポリジェニックリスクスコア（polygenic risk score; PRS）が、個人の自殺リスクを予測できる可能性を見出した。本研究では、自殺者/自殺未遂者試料の追加GWASを実施し計1,800例の日本人自殺者/自殺未遂者（及び20,000例の非自殺者）のGWASデータを用いることで、①日本人集団において自殺PRSがどの程度の確度で自殺リスクを予測できるか、②アジア人種において各精神疾患や喫煙・飲酒・身長・体重などの様々なヒト表現型がどの程度自殺と遺伝的リスクを共有しているか、の2点を精細に検討する。R4年度末までに約550例の自殺関連試料の追加収集・大部分のGWASデータ取得を実施し、BBJの非自殺者5,000例のコントロールデータとの統合中であり、最終年度の解析に向けて順調にサンプルサイズのスケールアップ・準備を進めることができた。また予備的解析結果において、白人集団におけるうつ病・統合失調症と自殺との遺伝的リスク共有度に比して、アジア人種におけるうつ病・統合失調症と自殺との遺伝的リスク共有度が弱い可能性を見出している。

The knowledge gained from the knowledge learned by others, and the information collected by those who have learned from others are compared to those in the world in the field of psychiatry. The applicant is the only one in China to apply for the largest model in the world. DNA data analysis (genome-wide association study; GWAS) data analysis (genome-wide association study; GWAS) data analysis, GWAS data analysis, and data analysis. In this study, GWAS was added to 1800 cases of Japanese self-employed

项目成果

Mapping the genetic architecture of suicide attempt and suicide death using polygenic risk scores for clinically-related psychiatric disorders and traits

使用临床相关精神疾病和特征的多基因风险评分绘制自杀未遂和自杀死亡的遗传结构

• DOI: 10.1017/s0033291721004700
• 发表时间: 2021
• 期刊: Psychological Medicine
• 影响因子: 6.9
• 作者: Otsuka Ikuo;Galfalvy Hanga;Guo Jia;Akiyama Masato;Rujescu Dan;Turecki Gustavo;Hishimoto Akitoyo;Mann J. John
• 通讯作者: Mann J. John

日本人自殺者のゲノムワイド関連解析

日本自杀事件的全基因组关联分析

• 发表时间: 2021
• 作者: 大塚郁夫;菱本明豊.
• 通讯作者: 菱本明豊.

Serum levels of glial cell line-derived neurotrophic factor as a biomarker for mood disorders and lithium response

• DOI: 10.1016/j.psychres.2021.113967
• 发表时间: 2021-04
• 期刊: Psychiatry Research
• 影响因子: 11.3
• 作者: Keita Idemoto;T. Niitsu;Tatsuki Hata;T. Ishima;S. Yoshida;K. Hattori;Tadasu Horai;Ikuo Otsuka;H. Yamamori;S. Toda;Yosuke Kameno;K. Ota;Y. Oda;Atsushi Kimura;T. Hashimoto;N. Mori;M. Kikuchi;Y. Minabe;R. Hashimoto;A. Hishimoto;K. Nakagome;K. Hashimoto;M. Iyo

Identification of Novel, Replicable Genetic Risk Loci for Suicidal Thoughts and Behaviors Among US Military Veterans

• DOI: 10.1001/jamapsychiatry.2022.3896
• 发表时间: 2022-12-14
• 期刊: JAMA PSYCHIATRY
• 影响因子: 25.8
• 作者: Kimbrel, Nathan A.;Ashley-Koch, Allison E.;Hauser, Michael A.
• 通讯作者: Hauser, Michael A.

Improving polygenic prediction in ancestrally diverse populations.

• DOI: 10.1038/s41588-022-01054-7
• 发表时间: 2022-05
• 期刊: NATURE GENETICS
• 影响因子: 30.8
• 作者: Ruan, Yunfeng;Lin, Yen-Feng;Feng, Yen-Chen Anne;Chen, Chia-Yen;Lam, Max;Guo, Zhenglin;He, Lin;Sawa, Akira;Martin, Alicia R.;Qin, Shengying;Huang, Hailiang;Ge, Tian
• 通讯作者: Ge, Tian