メンデルランダム化法を用いた生活習慣と緑内障の因果関係評価のための研究

孟德尔随机法评价生活习惯与青光眼因果关系的研究

• 批准号: 21K16883
• 负责人: 羽入田 明子
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-02-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K16883/
• 关键词: メンデルランダム化法; 緑内障; 糖代謝指標; 遺伝疫学; メンデルランダム化

本研究は、本邦の大規模分子疫学コンソーシアム（Japanese Consortium of Genetic Epidemiology Studies; J-CGE）のゲノムデータを用いてGWASを行い、緑内障の潜在的なリスク因子の遺伝要因を明らかにする。さらに、得られた遺伝情報を活用して、メンデルランダム化解析を実施することにより、交絡因子や因果の逆転を最小限とした、“日本人集団における生活・環境要因と緑内障のリスクの関連”に関する頑健なエビデンスを提供することを目標とする。本年度は、緑内障の潜在的なリスク因子のうち、メタアナリシスがでている糖代謝指標に着目し、空腹時血糖値、ヘモグロビンA1c、空腹時Cペプチド値の3つに対し、GWASカタログを用いて、GWAS基準で有意となるSNPを網羅的に検索した。当初、GWASカタログで検索すると、それぞれ299、180、115のSNPが該当し、そこから①不適格な形質、②GWAS有意基準を満たしていないもの、③性染色体、③重複、を除外したところ、それぞれ73、103、10SNPまで絞り込みができた。続いて、GWASカタログには掲載されていないメタGWASの結果（the Meta-Analysis of Glucose and Insulin related traits Consortium）から、空腹時血糖値、空腹時インスリン値に対し、37、17SNPをそれぞれ追加した。続いて、④Unmapped SNP、⑤multi-allelic SNP、⑥東アジア人でMAF<0.01を除外し、クランピングを施行したところ、最終的に３４（空腹時血糖値）、４３（ヘモグロビンA1c）、１７（空腹時Cペプチド値）のSNPを同定した。選定した糖代謝指標に対するそれぞれのSNPに対し、J-CGEに含まれる各コホートにそれぞれの糖代謝指標のGWASをお願いし、曝露とSNPとの関連（β値と標準誤差）を求めた。

This study シアム, domestic large-scale molecular Epidemiology コ ソ ソ シアム シアム シアム (Japanese Consortium of Genetic Epidemiology Studies; J - CGE) の ゲ ノ ム デ ー タ を with い て GWAS を い, glaucoma の potential な リ ス ク factor の heritage 伝 by を Ming ら か に す る. さ ら に, ら れ た heritage 伝 intelligence を use し て, メ ン デ ル ラ ン ダ ム resolve analysis を be applied す る こ と に よ り, winding factor や causal の inverse planning を minimum と し た, "Japanese people set 団 に お け る, living environment, by と glaucoma の リ ス ク の masato even" に masato す る robust な エ ビ デ ン ス を provide す る こ と を target と す る. This year は, glaucoma の potential な リ ス ク factor の う ち, メ タ ア ナ リ シ ス が で て い る sugar metabolism index に し, fasting blood glucose and numerical, ヘ モ グ ロ ビ ン A1c, hollow when C ペ プ チ ド numerical の 3 つ に し seaborne, GWAS カ タ ロ グ を with い て, GWAS benchmark で intentionally と な る SNP を snare of に 検 cable し た. At the beginning, GWAS カ タ ロ グ で 検 cable す る と, そ れ ぞ れ 299, 180, 115, の SNP が should し, そ こ か ら (1) inadequate な character, (2) the GWAS to benchmark を against た し て い な い も の, (3) sex chromosomes, (3) repeat, except を し た と こ ろ, そ れ ぞ れ 73, 103, 10 SNPS ま で ground り 込 み が で き た. Youdaoplaceholder0 続 て, GWASカタログに て published されて, な, メタGWAS <s:1> results (the Meta-Analysis of Glucose and Insulin related traits Consortium) か ら, on an empty stomach blood sugar numerical, hollow when イ ン ス リ ン numerical に し seaborne, 37, 17 SNP を そ れ ぞ れ additional し た. Youdaoplaceholder0 続 て, ④Unmapped SNP, ⑤multi-allelic SNP, 6 east ア ジ ア people で MAF < 0.01 except を し, ク ラ ン ピ ン グ を imposed し た と こ ろ, eventually に 34 (on an empty stomach blood sugar nt), 43 (ヘ モ グ ロ ビ ン A1c), 17 (hollow when C ペ プ チ ド nt) の SNP を be し た. Selected し た sugar metabolism index に す seaborne る そ れ ぞ れ の SNP に し seaborne, J - CGE に ま れ る each コ ホ ー ト に そ れ ぞ れ の sugar metabolism index の GWAS を お may い し, exposure と SNP と の masato even (beta) numerical と standard error を o め た.

项目成果

Association Between Glycemic Traits and Primary Open-Angle Glaucoma: A Mendelian Randomization Study in the Japanese Population

• DOI: 10.1016/j.ajo.2022.09.004
• 发表时间: 2022-11-05
• 期刊: AMERICAN JOURNAL OF OPHTHALMOLOGY
• 影响因子: 4.2
• 作者: Hanyuda, Akiko;Goto, Atsushi;Iwasaki, Motoki
• 通讯作者: Iwasaki, Motoki