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新規GT106ファミリーに属するラムノース転移酵素遺伝子の機能解析

新規GT106ファミリーに属するラムノース転移酵素遺伝子の機能解析
GT106家族鼠李糖转移酶基因的功能分析
批准号:
19K16173
负责人:
竹中 悠人
金额:
$2.58万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-04-01 至 2022-03-31

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项目成果

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植物細胞壁は地上最大のバイオマスであり、我々の日常生活から有用物質生産まで幅広く利活用されている。ペクチンは細胞壁の主成分であり、特に細胞が伸長している時に積極的に生合成される。ペクチンは最も構造が複雑な多糖であるため、その生合成機構は未解明な部分を多く残している。申請者は、蛍光標識したペクチンオリゴ糖を用いて、ペクチンを構成する主要ドメインであるラムノガラクツロナン-I(RG-I)の主鎖生合成に関わるラムノース転移酵素RRTを世界に先駆けて発見した。本研究では、RRT遺伝子をノックアウトした変異体を作出して表現型を解析することで、RRT遺伝子の生体内における機能を明らかにしようと試みた。RRT遺伝子は当初シロイヌナズナにおいて4つ見出されていたため、それぞれのノックアウト変異体をゲノム編集によって作出した。しかし、予想に反して表現型は野生型と酷似していた。RRT遺伝子を含む糖転移酵素ファミリーGT106を改めて見直し、配列の特徴を調べたところ、RRT1-4の隣接クレード6遺伝子もラムノース転移酵素である可能性が考えられた。そこで、既に変異体の表現型が解析されているFRB1を異種発現させ、ラムノース転移酵素活性を測定した。FRB1はRG-Iオリゴ糖にラムノース残基を転移させたことからRRT遺伝子であることが判明した。これにより、RRTはシロイヌナズナに10遺伝子存在する可能性が強く示唆された。さらにFRB1以外のRRT候補遺伝子を異種発現させたところ、3つの遺伝子で同様の活性が検出できた。上記の結果を受け、RRT1-10の発現プロファイルを解析したところ、花茎やロゼッタ葉では複数のRRT遺伝子の発現が観察された。一方、花器官では3つのRRT遺伝子が主に発現していることが分かった。最終年度は、この3遺伝子のノックアウト変異体の作成と解析を試みた。
期刊论文(13)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Unveiling pectin biosynthesis-There are more RRTs than we expected-
揭开果胶生物合成的面纱——RRT比我们预想的还要多——
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [Tsutsui Hiroki, Sato Yoshikatsu, Susaki Daichi, Higashiyama Tetsuya, Songkui Cui, 竹中悠人]
通讯作者: 竹中悠人
[Review] Toward the Elucidation of Molecular Mechanism for Biosynthesis of Pectin in Plant Cell Wal
[综述] 植物细胞壁果胶生物合成分子机制的阐明
DOI: 10.5458/bag.10.2_96
发表时间: 2020
期刊: Bulletin of Applied Glycoscience
影响因子: --
作者: [竹中悠人, 石水毅]
通讯作者: 石水毅
Biochemical characterization of pectin rhamnogalacturonan I galactosyltransferase
果胶鼠李糖半乳糖醛酸 I 半乳糖基转移酶的生化特性
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [Takenaka, Y., Matsumoto, N., Imai, T., Kajiura, H., Ishimizu, T.]
通讯作者: T.
ペクチンRG-I:ラムノース転移酵素遺伝子RRTの多様性
果胶RG-I:鼠李糖转移酶基因RRT的多样性
DOI: --
发表时间: 2020
期刊:
影响因子: --
作者: [川瀬摂・岩谷尚・浅野義哉・井上博元・工藤誠也・笹平素生・東信行・近藤大輔・関まどか・玄学南・坂元君年・岡本光・中舘雛姫・井上航・齋藤伊玖真・成田美優・関井清乃・小林一也, 山口 陽子, 竹中悠人]
通讯作者: 竹中悠人
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