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Identification of novel neoantigen candidates in cancers by full-length cDNA sequencing using a long read sequencer

Identification of novel neoantigen candidates in cancers by full-length cDNA sequencing using a long read sequencer
使用长读长测序仪进行全长 cDNA 测序，鉴定癌症中的新型新抗原候选物
批准号：
19K16792
负责人：
Suzuki Ayako
金额：
$2.66万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2019
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2019-04-01 至 2021-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K16792/
关键词：
ロングリードシークエンス全長cDNAシークエンス肺がんネオ抗原ロングリード非小細胞肺がんがん特異的転写産物ネオアンチジェンナノポアシークエンサー転写産物全長RNA-seqがん

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Aberrant splicing isoforms detected by full-length transcriptome sequencing as transcripts of potential neoantigens in non-small cell lung cancer.
DOI： 10.1186/s13059-020-02240-8
发表时间： 2021-01-04
期刊： Genome biology
影响因子： 12.3
作者： [Oka M, Xu L, Suzuki T, Yoshikawa T, Sakamoto H, Uemura H, Yoshizawa AC, Suzuki Y, Nakatsura T, Ishihama Y, Suzuki A, Seki M]
通讯作者： Seki M
Development of spatial genome and transcriptome analytical methods in local regions of lung cancer tissues
  • 批准号：
    21K15566
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 资助金额：
    $2.91万
  • 财政年份：
    2021
  • 负责人：
    Suzuki Ayako
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
Establishment of a noninvasive and quantitative quality evaluation method of a tissue-engineered oral mucosa fabricated using optical coherence tomography
  • 批准号：
    20K18556
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 资助金额：
    $2.75万
  • 财政年份：
    2020
  • 负责人：
    Suzuki Ayako
  • 依托单位：
    Niigata University
Modelling studies to identify the indirect effects of vaccines and the optimal immunizaion policies
Empirical analysis of asymmetric auction in electric power procurement auctions
  • 批准号：
    22730209
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 资助金额：
    $3.16万
  • 财政年份：
    2010
  • 负责人：
    Suzuki Ayako
  • 依托单位：
    Waseda University