Research and Development of Computational Storage Technology to Realize Large Scale Neuron Structure Visualization
Research and Development of Computational Storage Technology to Realize Large Scale Neuron Structure Visualization
批准号:
20H02194
负责人:
田中 陽一郎
金额:
$10.98万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-01 至 2024-03-31
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英文摘要
令和4年度は、全脳規模神経構造の3次元可視化解析を可能とするためのコンピュテーショナル・ストレージ解析テストベッドの構成を発展させ、全体で6つのコンピュートノードと11のストレージノードを一体化した。6-GPUs/24-CPUs(324コア)及び1344GBメモリに拡張したコンピュテーション 機能を実装した。同時に、大容量垂直HDDクラスタと高速SSDクラスタによるストレージを大幅に拡張して合計2.2PBのストレージ機能を一体化し、強力なコンピュ テーショナル・ストレージ解析プラットフォームを発展させた。これに分散オブジェクトストレージのCephファイルシステムを実装し、データ解析処理に関する性能を評価した。解析性能を最大化を目的にCephシステム内におけるデータ配置を最適化し、脳神経構造3次元可視化ツールとラット大脳皮質神経画像システムを適用した性能向上を検証した。大規模データ処理に対し、HDDクラスタ並列転送のメリットを活かしたエッジキャッシュの利用により、データアクセス性能を大幅に高めることが検証された。ストレージデバイスの研究開発では、熱アシスト型垂直磁気記録方式による多重化の可能性について継続して研究を実施した。上下二層構造の記録各層のキュリー温度を最適化しレーザー加温を制御することにより、記録密度を2倍に高める多重記録の性能を検証した。スピントルク発振素子を用いたニューロモルフィック記録構造の検討に着手した。神経構造・ダイナミック伝達機能の3次元可視化解析プラットフォームの開発では、3次元蛍光顕微鏡およびCaイメージングによるダイナミック神経伝達機能のデータアクイジションシステムを構築し、上記テストベッドを専用の高速光ネットワークで一体化し迅速なデータ転送とコンピュテーションを可能とした。
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Polydimethylsiloxane microfluidic films for in vitro engineering of mesoscale neuronal networks
用于中尺度神经元网络体外工程的聚二甲基硅氧烷微流体膜
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[H. Yamamoto, T. Takemuro, N. Monma, S. Sato, A. Hirano-Iwata]
通讯作者:
A. Hirano-Iwata
Computational storage platform for brain neural structure visualization analytics
用于脑神经结构可视化分析的计算存储平台
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Mag-usara Valynn Katrine, Escano Mary Clare, Petoukhoff Christopher E., Torosyan Garik, Scheuer Laura, Madeo Julien, Afalla Jessica, Talara Miezel L., Muldera Joselito E., Kitahara Hideaki, Bacon David R., Nakajima Makoto, Dani Keshav, Papaioannou Evangel, Yoichiro Tanaka]
通讯作者:
Yoichiro Tanaka
Ultrasoft silicone gel as a biomimetic scaffold for culturing neuronal networks in vitro
超软硅胶作为体外培养神经网络的仿生支架
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[H. Yamamoto, T. Sumi, A. Hirano-Iwata, S. Sato]
通讯作者:
S. Sato
Ultrasoft polydimethylsiloxane as a biomimetic scaffold for neuronal cultures
超软聚二甲基硅氧烷作为神经元培养的仿生支架
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[H. Yamamoto, T. Sumi, S. Sato, A. Hirano-Iwata]
通讯作者:
A. Hirano-Iwata
脳神経構造可視化ツールを用いた分散ストレージCephのデータアクセス性能の評価検討
利用脑神经结构可视化工具评估分布式存储Ceph的数据访问性能
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[川田悠貴, 田中陽一郎]
通讯作者:
田中陽一郎
共 44 条
Development of AFM-based quadruplex DNA detection method using data science technology
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批准号:20K06504
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.83万
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财政年份:2020
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负责人:田中 陽一郎
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依托单位:
海外基金