Visualizing protein motions using molecular photoswitching
Visualizing protein motions using molecular photoswitching
批准号:
20H02695
负责人:
水野 操
金额:
$11.32万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-01 至 2024-03-31
中文摘要
タンパク質の機能は、外部刺激による構造変化により生み出される。タンパク質機能を生み出す過渡的な分子運動の観測には、反応のタイミングが同期した分子アンサンブルのスペクトルを計測し、時間的精度が高い良質なスペクトルを得る必要である。これに対して、光による反応タイミングの制御がきわめて有効である。実際に、光受容タンパク質では光が外部刺激として構造変化を誘発するため、反応中間体の構造研究が多く行われている。一方、多くのタンパク質では、機能発現スイッチに光が利用されることはなく、時間的精度が高いダイナミクス観測が困難であった。本研究では、機能発現スイッチとして光反応により分子長や電荷分布が変化する小分子をタンパク質に導入し、反応タイミングの同期を行う(分子光スイッチング)。光によって誘起したタンパク質構造変化のダイナミクスを、芳香族アミノ酸残基および主鎖に由来するラマンバンドをプローブとして、時間分解紫外共鳴ラマン分光法により観測する。これにより、原子レベルの空間スケールかつピコ秒からサブ秒までの幅広い時間スケールで、機能発現に関わる構造ダイナミクスを観測する手法を確立する。本年度は、新たに幅広い波長チューニングが可能なパルスレーザーを導入し、タンパク質ダイナミクス観測のさらなる高感度化を実現した。一方、試料調製方法について、昨年度から引き続き検討しているが、まだ実施には至っていない。外部機関の研究者との研究協力をあおぐ必要がある。
英文摘要
タンパク質の機能は、外部刺激による構造変化により生み出される。タンパク質機能を生み出す過渡的な分子運動の観測には、反応のタイミングが同期した分子アンサンブルのスペクトルを計測し、時間的精度が高い良質なスペクトルを得る必要である。これに対して、光による反応タイミングの制御がきわめて有効である。実際に、光受容タンパク質では光が外部刺激として構造変化を誘発するため、反応中間体の構造研究が多く行われている。一方、多くのタンパク質では、機能発現スイッチに光が利用されることはなく、時間的精度が高いダイナミクス観測が困難であった。本研究では、機能発現スイッチとして光反応により分子長や電荷分布が変化する小分子をタンパク質に導入し、反応タイミングの同期を行う(分子光スイッチング)。光によって誘起したタンパク質構造変化のダイナミクスを、芳香族アミノ酸残基および主鎖に由来するラマンバンドをプローブとして、時間分解紫外共鳴ラマン分光法により観測する。これにより、原子レベルの空間スケールかつピコ秒からサブ秒までの幅広い時間スケールで、機能発現に関わる構造ダイナミクスを観測する手法を確立する。本年度は、新たに幅広い波長チューニングが可能なパルスレーザーを導入し、タンパク質ダイナミクス観測のさらなる高感度化を実現した。一方、試料調製方法について、昨年度から引き続き検討しているが、まだ実施には至っていない。外部機関の研究者との研究協力をあおぐ必要がある。
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Elucidation of intramolecular heat transfer mechanism for construction of highly effective photothermal protein heaters(高 効率光熱変換タンパク質ヒーター創出に向けた分子内熱伝導機構の解明)
阐明分子内传热机制构建高效光热蛋白质加热器
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Keiichi Ueda, Daiki Katsube, Eiichi Inami, Masayuki Abe, 水野 操]
通讯作者:
水野 操
共鳴ラマン分光法による祖先型グロビンフォールドタンパク質のヘム-軸配位子構造の解明
通过共振拉曼光谱阐明祖先珠蛋白折叠蛋白的血红素轴配体结构
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[入谷 悠, 石川 春人, 水野 操, 水谷 泰久]
通讯作者:
水谷 泰久
レチナールアナログ置換によるヘリオロドプシン発色団の構造特異性の解明
通过视网膜类似物取代阐明日光视紫红质发色团的结构特异性
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[潤井 泰斗, 水野 操, 水谷 泰久]
通讯作者:
水谷 泰久
ヘリオロドプシンの光サイクルにおけるレチナールシッフ塩基の水素結合強度の変遷
日光视紫红质光循环过程中视网膜席夫碱氢键强度的变化
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[潤井 泰斗, 水野 操, 神取 秀樹, 水谷 泰久]
通讯作者:
水谷 泰久
Time-resolved resonance Raman observation of the chromophore structure in primary intermediates of microbial rhodopsins
微生物视紫红质初级中间体发色团结构的时间分辨共振拉曼观察
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Zixuan Li, Misao Mizuno, Hideki Kandori, Yasuhisa Mizutani]
通讯作者:
Yasuhisa Mizutani
共 34 条
タンパク質化学反応と構造変化における双方向カップリングの動的制御
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批准号:24K01436
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.81万
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财政年份:2024
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负责人:水野 操
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依托单位:
センサータンパク質の信号伝達における共通立体構造の役割
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批准号:20038037
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.92万
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财政年份:2008
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负责人:水野 操
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依托单位:
海外基金