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Construction of highly efficient enzyme reaction system by high-ordered self-assembly of DNA nanostructure

DNA纳米结构高序自组装构建高效酶反应体系

基本信息

批准号：
20H02860
负责人：
中田栄司
金额：
$ 11.4万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

DNAナノ構造体を足場として、酵素を1分子レベルで配置したナノ空間内で高効率な酵素連続反応場の設計原理を確立するのが目的である。これまでに開発してきた独自の手法である「DNA結合性アダプター法」には、複数種類の酵素を配置するためには一定の利用制限があることが明らかであった。これを反応メカニズムを基に再設計することで、複数種類の酵素を配置する際に用いることができるDNA結合性アダプター(モジュール型アダプター)の選択肢の拡充を図り、その獲得に成功した。具体的には、モジュール型アダプターの構成要素であるDNA結合性タンパク質とタグタンパク質のうち、DNA結合性タンパク質の多様性を利用して直交性を発揮するモジュール型アダプターの設計戦略とその実施をおこなった。タグタンパク質の反応性が高すぎるために選択性が発揮できないことが明らかとなったため、あえて反応性を抑制する設計を施し、その結果、期待したような直交性を有するDNA結合性アダプターの拡充に成功した。これは、タグタンパク質に比べると、DNA結合性タンパク質には様々な選択肢があることを考慮すると、より柔軟な選択ができるような方法論へと洗練できたと考えている。また、反応場が酵素反応自体に及ぼす影響についての評価及び考察もおこなった。また、別途DNAが集積することで形成される液相状態の構築をおこない、その構造的特徴の測定評価をおこなった。ナノ構造体の階層的集積化については進行中である。

The design principles of DNA enzyme-linked enzyme-linked counter-site design are established in the design principle of the high-rate enzyme-linked counter-site design principle of enzyme-linked high-rate enzyme-linked counter-site design principles to ensure that the target temperature is sensitive. It is necessary to make use of the combination of DNA and other enzymes such as the combination of enzymes and multiplicative enzymes to make sure that you can make use of the restriction system to analyze the data. In this paper, the anti-virus system is designed again, and the enzyme configuration of the complex enzyme is used to use the combination of the enzyme DNA to complete the test, and the test results are successful. The key elements of the real-time cross-sectional communication system, such as the combination of DNA, the combination of two, and the multiplicity of the combination of DNA and DNA, are used in the design of the design of the cross-sectional cluster. This is not true. It is expected that the DNA combination test is successful. In this paper, the results are as follows: in this paper, we compare the results of the test, the combination of DNA and so on, so that we can compare the results of the test, the results of the test, the combination of the test, the combination of the two, the test of the method, the method of the test, the test of the method and so on. The enzyme of anti-market and anti-enzyme is used to treat the disease, and the effect of the enzyme is different. On the other hand, the DNA system is used to determine the performance of the liquid phase. The centralization of the structure and structure of the system is in progress.