微小器官でのエピゲノム解析系を用いた植物生殖系列の確立の解明

利用微生物表观基因组分析系统阐明植物种系的建立

基本信息

  • 批准号:
    20J01486
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.41万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2020
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2020-04-24 至 2023-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

エピゲノムに関する変異は配偶子形成・受精・胚発生などに異常をきたすことから、有性生殖の成功にはエピゲノムの制御が重要であると言える。植物の生殖細胞の分化過程では、DNA メチル化がダイナミックに変化することが知られている。しかし、CG メチル化はゲノムインプリンティングなど有性生殖における機能が分かりつつある一方で、CHH メチル化は、特徴的な動態を示すにも関わらず、その機能は不明である、DNA メチル化とヒストン修飾は相互に作用して、クロマチン構造や転写因子の標的への結合能の制御に関与することがわかってきた。植物の生殖細胞の分化過程の本質を理解するためには、DNA メチル化・ヒストン修飾-クロマチン構造-遺伝子発現の関係を明らかにする必要があると考えられる。そこで、本研究課題では、微量試料でのエピゲノム解析の新規技術を植物の発生学に導入し、花成から生殖細胞分化までのDNA メチル化およびヒストン修飾の動態を解析し、その遺伝子発現に対する影響を明らかにすることで、植物の生殖細胞の分化過程の本質を理解することを研究の目的とした。今年度は、Post Bisulfite Adaptor Tagging (PBAT)法を用いて、単離したイネの茎頂分裂組織のDNAメチル化動体を花成の前と後で比較して明らかとなった、成果を論文として公表した。PBAT法により明らかとなったDNAメチル化動体をより時空間的に高解像度で解析するために、CG・CHG・CHHメチル化率を可視化できるイネ形質転換体の作成を行った。また、微小器官である単離したイネの茎頂分裂組織でのヒストン就職状態を解析するために、ChIL-seq法の条件検討を行ない、スライドガラス上で単離した組織の内部まで抗原抗体反応を行う条件を見いだした。
エピゲノムに关する変differentはSpouse formation, fertilization, embryogenesis などにAbnormality をきたすことから、The success of sexual reproduction is important for the success of sexual reproduction. The process of differentiation of reproductive cells in plants, and the process of DNA transformation.しかし、CG メチル化はゲノムインプリンティングなどsexual reproduction におけるFUNCTION が分かりつつある一 Partyで、CHHメチル化は, special dynamic をshow すにも关わらず, そのFUNCTION はUnknown である, DNAメチル化とヒストンmodificationはinteractionして、クロマチンstructuringや転Write the factor's standard へのcombination energy and することがわかってきた. Understanding the essence of the differentiation process of reproductive cells in plants, DNAメチル化・ヒストンmodification-クロマチンstructure-缝子発 appearのrelationsを明らかにするNecessaryがあると考えられる.そこで, This research topic is では, Micro-sample でのエピゲノムanalytical new regulation technology をPlant の発生学にIntroduction し, 花成からReproductive cell differentiation までのDNAメチル化およびヒストンmodificationのdynamicをanalyticし、その缝子発appearsに対するimpactを明らかThe purpose of research is to understand the essence of the differentiation process of plant germ cells and to understand the purpose of research. This year's Post Bisulfite Adapter Tagging (PBAT) method is to use いて, single separation of the stem top division tissue of the DNA メチルComparison of the before and after of the body and flowers, the results of the paper and the public table of the results. The PBAT method is a high-resolution analysis of time and space that uses DNA to transform animals.ために, CG・CHG・CHH メチル化ratio をVisualization できるイネmorphological change body の成を行った. ChIL-se The conditions of the q method are the conditions of the line and the conditions of the line.

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
茎頂分裂組織の成長相転換におけるエピゲノムの動態~生殖細胞の分化の理解に向けて~
茎尖分生组织生长阶段转变过程中表观基因组的动态〜了解生殖细胞分化〜
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    石井孝佳;長岐清孝;菊池真司;山崎祥他;内田開,稲葉ジュン,佐藤心郎,平井優美;肥後あすか
  • 通讯作者:
    肥後あすか
DNA methylation is reconfigured at the onset of reproduction in rice shoot apical meristem
  • DOI:
    10.1038/s41467-020-17963-2
  • 发表时间:
    2020-08-14
  • 期刊:
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Higo, Asuka;Saihara, Noriko;Tsuji, Hiroyuki
  • 通讯作者:
    Tsuji, Hiroyuki
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肥後 あすか其他文献

ゼニゴケの生活環におけるMpMS1の機能解析
MpMS1在地钱生命周期中的功能分析
  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三枝 菜摘;國本 完;肥後 あすか;神原 泉;冨田 由妃;井上 佳祐;山岡 尚平;荒木 崇
  • 通讯作者:
    荒木 崇
シロイヌナズナ受精卵の発生過程におけるCENH3マークの新規形成を制御するクロマチンクロストークの解析
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三枝 菜摘;國本 完;肥後 あすか;神原 泉;冨田 由妃;井上 佳祐;山岡 尚平;荒木 崇;永原史織,東山哲也,Frederic Berger,武内秀憲
  • 通讯作者:
    永原史織,東山哲也,Frederic Berger,武内秀憲
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地钱中精子细胞特异性RNA调控机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    井上 佳祐;小谷 莞太;真柴 誠;穴田 小恵;肥後 あすか;山岡 尚平;荒木 崇
  • 通讯作者:
    荒木 崇
細胞間コミュニケーションを設計して細胞に自律的にパターン形成させる
设计细胞间通讯以允许细胞自主形成模式
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三枝 菜摘;國本 完;肥後 あすか;神原 泉;冨田 由妃;井上 佳祐;山岡 尚平;荒木 崇;永原史織,東山哲也,Frederic Berger,武内秀憲;戸田 聡
  • 通讯作者:
    戸田 聡

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    2022
  • 资助金额:
    $ 2.41万
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    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

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    08J04777
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    $ 2.41万
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    20061004
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    2008
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    2006
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    2004
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    13017203
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