微小器官でのエピゲノム解析系を用いた植物生殖系列の確立の解明

利用微生物表观基因组分析系统阐明植物种系的建立

• 批准号: 20J01486
• 负责人: 肥後 あすか
• 金额: $ 2.41万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-24 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20J01486/
• 关键词: エピゲノム動態; 茎頂分裂組織; 生殖; イネ

エピゲノムに関する変異は配偶子形成・受精・胚発生などに異常をきたすことから、有性生殖の成功にはエピゲノムの制御が重要であると言える。植物の生殖細胞の分化過程では、DNA メチル化がダイナミックに変化することが知られている。しかし、CG メチル化はゲノムインプリンティングなど有性生殖における機能が分かりつつある一方で、CHH メチル化は、特徴的な動態を示すにも関わらず、その機能は不明である、DNA メチル化とヒストン修飾は相互に作用して、クロマチン構造や転写因子の標的への結合能の制御に関与することがわかってきた。植物の生殖細胞の分化過程の本質を理解するためには、DNA メチル化・ヒストン修飾-クロマチン構造-遺伝子発現の関係を明らかにする必要があると考えられる。そこで、本研究課題では、微量試料でのエピゲノム解析の新規技術を植物の発生学に導入し、花成から生殖細胞分化までのDNA メチル化およびヒストン修飾の動態を解析し、その遺伝子発現に対する影響を明らかにすることで、植物の生殖細胞の分化過程の本質を理解することを研究の目的とした。今年度は、Post Bisulfite Adaptor Tagging (PBAT)法を用いて、単離したイネの茎頂分裂組織のDNAメチル化動体を花成の前と後で比較して明らかとなった、成果を論文として公表した。PBAT法により明らかとなったDNAメチル化動体をより時空間的に高解像度で解析するために、CG・CHG・CHHメチル化率を可視化できるイネ形質転換体の作成を行った。また、微小器官である単離したイネの茎頂分裂組織でのヒストン就職状態を解析するために、ChIL-seq法の条件検討を行ない、スライドガラス上で単離した組織の内部まで抗原抗体反応を行う条件を見いだした。

エ ピ ゲ ノ ム に masato す る - different は gamete formation, fertilization, embryo 発 raw な ど に abnormal を き た す こ と か ら, sexual reproduction の successful に は エ ピ ゲ ノ ム の suppression が important で あ る と said え る. Plant の germ cell differentiation process で の は, DNA メ チ ル change が ダ イ ナ ミ ッ ク に variations change す る こ と が know ら れ て い る. し か し, CG メ チ ル change は ゲ ノ ム イ ン プ リ ン テ ィ ン グ な ど sexual reproduction に お け る function が points か り つ つ あ る で, CHH メ チ ル は, especially 徴 な dynamic を shown す に も masato わ ら ず, そ の function は unknown で あ る, DNA メ チ ル change と ヒ ス ト ン modified は interaction に し て, ク ロ マ チ や ン structure planning write factor の mark へ の binding energy の suppression に masato and す る こ と が わ か っ て き た. Plant の を understanding of nature of germ cell differentiation process の の す る た め に は, DNA メ チ ル change · ヒ ス ト ン modification - ク ロ マ チ ン structure - heritage 伝 son 発 is の masato を and Ming ら か に す る necessary が あ る と exam え ら れ る. そ こ で, this research topic で は, trace sample で の エ ピ ゲ ノ ム parsing の new rules technology を plant の 発 に import し, flowers into か ら germ cell differentiation ま で の DNA メ チ ル change お よ び ヒ ス ト ン modified の dynamic analytical し を, そ の posthumous son 伝 発 now に す seaborne る influence を Ming ら か に す る こ と で, plant の を understanding of nature of germ cell differentiation process の の す る こ と purpose の を study と し た. Our は, Post Bisulfite Adaptor Tagging method (PBAT) を with い て, 単 し た イ ネ の stem top separatist group の DNA メ チ ル change before moving body を flowers into の と で after comparing し て Ming ら か と な っ result を た, と し て male table し た. PBAT method に よ り Ming ら か と な っ た DNA メ チ ル the kinetosome を よ り に space when high resolution analytical す で る た め に, CG, CHG, CHH メ チ ル flowrate を visualization で き る イ ネ form quality planning in body の made を line っ た. ま た, tiny organs で あ る 単 from し た イ ネ の stem top separatist group で の ヒ ス ト ン employment status を parsing す る た め に, ChIL - seq 検 の conditions for line を な い, ス ラ イ ド ガ ラ ス on で 単 from し た の internal ま で antigen antibody against 応 を line う conditions を see い だ し た.

项目成果

茎頂分裂組織の成長相転換におけるエピゲノムの動態～生殖細胞の分化の理解に向けて～

茎尖分生组织生长阶段转变过程中表观基因组的动态〜了解生殖细胞分化〜

• 发表时间: 2021
• 作者: 石井孝佳;長岐清孝;菊池真司;山崎祥他;内田開，稲葉ジュン，佐藤心郎，平井優美;肥後あすか
• 通讯作者: 肥後あすか

DNA methylation is reconfigured at the onset of reproduction in rice shoot apical meristem

• DOI: 10.1038/s41467-020-17963-2
• 发表时间: 2020-08-14
• 期刊: NATURE COMMUNICATIONS
• 影响因子: 16.6
• 作者: Higo, Asuka;Saihara, Noriko;Tsuji, Hiroyuki
• 通讯作者: Tsuji, Hiroyuki